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小菜蛾清道夫受体基因家族鉴定与生物信息学分析
引用本文:谭建彬,徐 进,师沛琼,周鸿凯. 小菜蛾清道夫受体基因家族鉴定与生物信息学分析[J]. 广东农业科学, 2023, 50(5): 94-102
作者姓名:谭建彬  徐 进  师沛琼  周鸿凯
作者单位:广东海洋大学滨海农业学院,广东 湛江 524088
基金项目:广东省基础与应用基础研究基金(2019A1515110745);广东省科技专项资金(2020A06013);广东海洋大学科研启动经费资助项目(R19025,R19029)
摘    要:【目的】小 菜蛾(Plutella xylostella)对化学杀虫性抗药性逐年上升,使 RNAi (RNA interference)农药广受关注。小菜蛾清道夫受体 (Scavenger receptor, SR)在细胞免疫中表现出吞噬和清除病原体的能力,使其成为 RNAi 农药的备选靶标基因。为确定小菜蛾 SR 基因相关靶标,鉴定分析了小菜蛾 SR 基因家族成员信息。【方法】基于全基因组数据,对小菜蛾 SR 基因家族的理化性质、跨膜结构、系统发育进化、蛋白质二三级结构预测、蛋白保守基序、磷酸化位点预测等内容进行分析。【结果】 小菜蛾 SR 基因家族有 12 个 CD36 蛋白序列,具有相似的理化性质和功能结构,均含有多个亲水性和疏水性区域及 2 个跨膜螺旋区,蛋白质二、三级结构的主要特征为无规则卷曲,磷酸化位点中丝氨酸含量最高。小菜蛾与家蚕(Bombyx mori)、冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)、黑腹果蝇(Drosophila melanogaster)、烟草天蛾(Manduca sexta)、赤拟谷盗(Tribolium castaneum)等 6 个物种共包含 117 条 CD36 蛋白序列,这些序列在进化树上分成 5 个分支,具有相似结构的基因聚为同一支,进化保守性强。小菜蛾 CD36px4、CD36px5 具有更复杂的三级结构,且 motif19、motif20 两个基序只存在 于 CD36px4,推测其在物种进化中发挥某些特异功能,CD36px4 磷酸化位点数量多达 143 个,可能与凋亡细胞的吞噬和清除功能表达有关。【结论】鉴定分析到 12 个小菜蛾 SR 蛋白均为跨膜型蛋白,且含有丰富的磷酸化位点,预测其可参与细胞内外物质传输、信号传递及能量代谢等机体活动,具有介导细胞凋亡、吞噬和清除凋亡细胞的功能,可作为 RNAi 农药的备选靶标,为小菜蛾 RNAi 农药靶标的筛选提供重要依据。

关 键 词:小菜蛾;清道夫受体;基因家族;CD36;RNAi;功能结构

Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of Scavenger Receptor Gene Family in Plutella xylostella
TAN Jianbin,XU Jin,SHI Peiqiong,ZHOU Hongkai. Genome-wide Identification and Bioinformatics Analysis of Scavenger Receptor Gene Family in Plutella xylostella[J]. Guangdong Agricultural Sciences, 2023, 50(5): 94-102
Authors:TAN Jianbin  XU Jin  SHI Peiqiong  ZHOU Hongkai
Abstract:
Keywords:Plutella xylostella    scavenger receptor   gene family   CD36   RNAi   functional structure
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