| 基于16S rRNA高通量测序的长江口日本鳗鲡幼体肠道微生物群落研究 |
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| 引用本文： | 常亚娟,唐文乔,郭弘艺. 基于16S rRNA高通量测序的长江口日本鳗鲡幼体肠道微生物群落研究[J]. 中国水产科学, 2023, 30(6): 699-710 |
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| 作者姓名： | 常亚娟 唐文乔 郭弘艺 |
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| 作者单位： | 上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室, 上海 201306;上海海洋大学海洋动物系统分类与进化上海高校重点实验室, 上海 201306 ;上海海洋大学, 水产种质资源发掘与利用省部共建教育部重点实验室, 上海 201306 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2018YFD0900802); 国家自然科学基金项目(31093430). |
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| 摘 要： | 为了解长江口日本鳗鲡(Anguilla japonica)幼体肠道微生物的结构特点和多样性组成,探索其潜在功能,采用MiSeq 16S rRNA高通量测序技术对2022年1―4月每月VA期和VB期2个发育时期的肠道样本进行微生物测序,分析了肠道微生物的OTU数量、菌群组成、丰度及Alpha多样性,并预测其功能。8个样本共测得1467个OTU,每个样本平均396个。共鉴定出51门、140纲、286目、414科、643属、959种,每个样本平均包含26门和229属,并表现出随月份递增而门数和属数明显减少的现象。在门水平上,以变形菌门(Proteobacteria)(81.33%)和拟杆菌门(Bacteroidota)(10.61%)为优势菌群。在属水平上,主要由嗜冷杆菌属(Psychrobacter)(35.10%)、假单胞菌属(Pseudomonas)(16.75%)、黄杆菌属(Flavobacterium)(7.99%)、无色杆菌属(Achromobacter)(4.82%)、希瓦氏菌属(Shewanella)(4.21%)等组成,显示了一组与其他鱼类不同的肠道微生物群落。1月组的肠道...
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| 关 键 词： | 长江口 日本鳗鲡 16S rRNA 肠道微生物 优势菌群 功能预测 |
| 收稿时间： | 2023-04-09 |
| 修稿时间： | 2023-04-19 |
Study on the intestinal microbial community of Japanese eel larvae in the Yangtze River Estuary based on 16S rRNA high-throughput sequencing |
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| CHANG Yajuan,TANG Wenqiao,GUO Hongyi. Study on the intestinal microbial community of Japanese eel larvae in the Yangtze River Estuary based on 16S rRNA high-throughput sequencing[J]. Journal of Fishery Sciences of China, 2023, 30(6): 699-710 |
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| Authors: | CHANG Yajuan TANG Wenqiao GUO Hongyi |
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