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大麦耐盐相关性状的全基因组关联分析
引用本文:栾海业,孟 炜,张英虎,李 钰,朱琳洁,王 裕,刘雨倩,徐 肖,刘方方,沈会权.大麦耐盐相关性状的全基因组关联分析[J].麦类作物学报,2024(6):729-734.
作者姓名:栾海业  孟 炜  张英虎  李 钰  朱琳洁  王 裕  刘雨倩  徐 肖  刘方方  沈会权
作者单位:(1.盐城师范学院,江苏盐城 224007; 2.江苏沿海地区农业科学研究所,江苏盐城 224002)
基金项目:江苏省自然科学基金项目(BK20201215);国家大麦青稞产业技术体系项目(CARS-05);盐城市农业重点研发计划项目(YCBN202308)
摘    要:为挖掘控制大麦耐盐相关性状的重要位点及候选基因,以国内外不同遗传背景的164份大麦品种为材料,在大麦萌发期,用200 mmol·L-1NaCl处理种子,测定大麦相对发芽率、生根数、根长、芽长、鲜重5个指标并分析其相关性。结果发现,200 mmol·L-1NaCl处理显著影响了大麦的生长,5个被测指标的变异系数为20.29%~63.00%。除相对发芽率外,其他性状间均呈显著正相关,相关系数为0.41~0.68。通过全基因组关联分析,发现148个SNP位点与大麦耐盐性显著关联;筛选出5个可靠SNP位点,分别分布在1号、 2号、3号、6号、7号染色体上。通过比较大麦基因组,挖掘出26个可能与大麦耐盐性状密切相关的候选基因,包括HORVU7Hr1G097370和HORVU7Hr1G097390编码碱性亮氨酸拉链域转录因子家族蛋白、HORVU7Hr1G096920编码高亲和K+转运体、多个基因家族编码过氧化物酶超家族蛋白等。这些候选基因可为大麦耐盐品种选育提供参考。

关 键 词:大麦  耐盐性状  全基因组关联分析  候选基因

Genome-Wide Association Analysis of Traits Related to Salt Tolerance in Barley
LUAN Haiye,MENG Wei,ZHANG Yinghu,LI Yu,ZHU Linjie,WANG Yu,LIU Yuqian,XU Xiao,LIU Fangfang,SHEN Huiquan.Genome-Wide Association Analysis of Traits Related to Salt Tolerance in Barley[J].Journal of Triticeae Crops,2024(6):729-734.
Authors:LUAN Haiye  MENG Wei  ZHANG Yinghu  LI Yu  ZHU Linjie  WANG Yu  LIU Yuqian  XU Xiao  LIU Fangfang  SHEN Huiquan
Institution:(1.Yancheng Teachers University, Yancheng, Jiangsu 224002, China; 2.Jiangsu Coastal Area Institute of Agricultural Sciences, Yancheng, Jiangsu 224002, China)
Abstract:
Keywords:Barley  Salt-tolerance  Genome-wide association analysis  Candidate genes
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