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彩色小麦株高与籽粒性状的全基因组关联分析
引用本文:李浩阳,顾晶晶,赵文莎,宋鹏博,赵慧玲,张傲琰,张传量,王琪琳,孙道杰.彩色小麦株高与籽粒性状的全基因组关联分析[J].麦类作物学报,2024(6):718-728.
作者姓名:李浩阳  顾晶晶  赵文莎  宋鹏博  赵慧玲  张傲琰  张传量  王琪琳  孙道杰
作者单位:(1.西北农林科技大学农学院,陕西杨凌 712100; 2.洛阳市农林科学院,河南洛阳 471000;3.陕西九丰农业科技有限公司,陕西宝鸡 722299)
基金项目:国家重点研发计划项目(2016YFD0101802)
摘    要:彩色小麦的产量通常低于普通白粒和红粒小麦,籽粒偏小是原因之一。为解析控制彩色小麦产量性状的遗传基础,分析了239份彩色小麦品种(系)在4个环境下的表型特性和16 K SNP芯片基因型数据,对株高和籽粒性状(千粒重、籽粒长、籽粒宽和籽粒长宽比)的QTL进行了全基因组关联分析(genome-wide-association-study, GWAS)。结果显示,各表型性状的变异系数为5.11%~32.91%,广义遗传力为71.88%~97.00%,多数性状之间具有显著相关性。通过GWAS共筛选出26 728个多态性SNP标记,定位到了17个与目标性状显著相关的稳定QTL位点,分布在1A、1B、1D、2B等12条染色体上,单个QTL解释5.26%~11.66%的表型变异,其中在3个环境下均被检测到的QTL有5个,分别为QPh.nwafu-4B.1、QKlwr.nwafu-1D、QKlwr.nwafu-4D、QKlwr.nwafu-5B.1和QKlwr.nwafu-6A.2;共发现10个未见报道的新QTL位点,分别为与株高相关的QPh.nwafu-4B.3,与千粒重相关的QTkw.nwafu-3B和QTkw.nwafu-6A,与籽粒长宽比相关的QKlwr.nwafu-1A、QKlwr.nwafu-1B、QKlwr.nwafu-4A、QKlwr.nwafu-5B.2、QKlwr.nwafu-6A.1和QKlwr.nwafu-6A.2。这些QTL位点初步表明了彩色小麦株高与籽粒性状基因位点的分布、组成,可为彩色小麦产量遗传改良提高参考。

关 键 词:彩色小麦  株高  籽粒性状  GWAS  SNP

Genome-Wide Association Study of Plant Height and Kernel Traits of Color Wheat
LI Haoyang,GU Jingjing,ZHAO Wensh,SONG Pengbo,ZHAO Huiling,ZHANG Aoyan,ZHANG Chuanliang,WANG Qilin,SUN Daojie.Genome-Wide Association Study of Plant Height and Kernel Traits of Color Wheat[J].Journal of Triticeae Crops,2024(6):718-728.
Authors:LI Haoyang  GU Jingjing  ZHAO Wensh  SONG Pengbo  ZHAO Huiling  ZHANG Aoyan  ZHANG Chuanliang  WANG Qilin  SUN Daojie
Institution:(1.Collage of Agronomy,Northwest A&F University, Yangling, Shaanxi 712100, China; 2.Luoyang Academy of Agriculture and Forestry Sciences, Luoyang, Henan 471000; 3.Shaanxi Jiufeng Agricultural Science and Technology Limited Company, Baoji, Shaanxi 722299, China)
Abstract:
Keywords:Color wheat  Plant height  Kernel traits  GWAS  SNP
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