黄瓜转录因子CsCBF3 的克隆及表达分析 |
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引用本文: | 宁宇,苗永美,李季,娄群峰,翁益群,陈劲枫.黄瓜转录因子CsCBF3 的克隆及表达分析[J].中国蔬菜,2013,1(6):30-36. |
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作者姓名: | 宁宇 苗永美 李季 娄群峰 翁益群 陈劲枫 |
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作者单位: | (;1. 南京农业大学园艺学院,作物遗传与种质创新国家重点实验室,江苏南京210095;;2.安徽科技;
学院生命科学学院,安徽凤阳 233100;;3.美国威斯康星大学园艺系,威斯康星麦迪逊 53706) |
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基金项目: | 国家“973”计划项目(2009CB119001);国家自然科学基金重点项目(30830079);江苏省农业科技自主创新基金项目(CX(11)1002) |
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摘 要: | 利用RT-PCR 技术从黄瓜中克隆了植物低温信号转导途径中的关键转录因子C-repeat-Binding
Factor3,将其命名为CsCBF3,GenBank 登录号为JQ900769。CsCBF3 基因开放阅读框全长为615 bp,
编码204 个氨基酸。进化树分析表明,CsCBF3 隶属于CBF 基因家族,与葡萄CBF3 蛋白亲缘关系最近,
而与黑麦草、水稻CBF3 蛋白亲缘关系较远。生物信息学分析结果表明,CsCBF3 编码的蛋白包含保守的
AP2 DNA 结合域,N 端的核定位信号区和C 端的酸性氨基酸富集区,且该蛋白中的一些磷酸化位点及二
级结构在与DNA 互作过程中发挥重要作用。荧光定量PCR 检测结果显示低温可诱导CsCBF3 的表达,且
其表达量在迅速达到峰值后又降低,说明CsCBF3 是一个快速响应基因,推测其在黄瓜耐冷过程中起着重
要的作用。
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关 键 词: | 黄瓜 低温 CBF3 基因克隆 表达分析 |
收稿时间: | 2012-09-17; |
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