| 甘蓝型油菜BnAPs基因家族成员全基因组鉴定及分析 |
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| 引用本文： | 黄成,梁晓梅,戴成,文静,易斌,涂金星,沈金雄,傅廷栋,马朝芝. 甘蓝型油菜BnAPs基因家族成员全基因组鉴定及分析[J]. 作物学报, 2022, 0(3): 597-607 |
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| 作者姓名： | 黄成 梁晓梅 戴成 文静 易斌 涂金星 沈金雄 傅廷栋 马朝芝 |
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| 作者单位： | 华中农业大学作物遗传改良国家重点实验室/国家油菜工程技术研究中心 |
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| 基金项目： | 湖北省重点研发计划项目(2020BBB061);国家重点研发计划项目(2016YFD100803)资助。 |
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| 摘 要： | 天冬氨酸蛋白酶(AP)属于四大蛋白水解酶之一,在蛋白质加工、信号转导和胁迫反应中发挥着重要作用。甘蓝型油菜是我国重要的油料作物,利用蛋白质同源性分析,在甘蓝型油菜中鉴定出154个APs编码基因,分别编码典型、非典型和珠心类天冬氨酸蛋白酶。基因结构分析结果表明,多数BnAPs基因包含1～4个外显子,同一类型的天冬氨酸蛋白酶成员之间蛋白质基序(Motif)分布相似。共线性分析表明,甘蓝型油菜与白菜、甘蓝和拟南芥存在大量的同源基因,约89%的BnAPs基因来自于全基因组复制事件。转录水平检测结果表明,BnAPs基因家族成员在各个组织中均有表达,其中BnAP30.A05.1/A05.2/C05.1/C05.2、BnAP36.A04/C08、BnAP39.A06/C03在授粉后的柱头显著提高。BnAPs基因启动子区域顺式元件分析结果表明,逆境相关的顺式调控元件被显著富集;进一步利用RT-qPCR验证了这些富含逆境相关顺式调控元件的基因在逆境(ABA、NaCl或4℃)处理后的表达水平显著变化,推测这些BnAPs基因可能参与甘蓝型油菜对逆境的响应。进一步和拟南芥同源基因组织表达模式进行比较后发现,大...
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 天冬氨酸蛋白酶 共线性分析 表达模式 RT-qPCR |
Genome wide analysis of BnAPs gene family in Brassica napus |
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| HUANG Cheng,LIANG Xiao-Mei,DAI Cheng,WEN Jing,YI Bin,TU Jin-Xing,SHEN Jin-Xiong,FU Ting-Dong,MA Chao-Zhi. Genome wide analysis of BnAPs gene family in Brassica napus[J]. Acta Agronomica Sinica, 2022, 0(3): 597-607 |
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| Authors: | HUANG Cheng LIANG Xiao-Mei DAI Cheng WEN Jing YI Bin TU Jin-Xing SHEN Jin-Xiong FU Ting-Dong MA Chao-Zhi |
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| Affiliation: | (National Key Laboratory of Crop Genetic Improvement/National Engineering Research Center of Rapeseed,Huazhong Agricultural University,Wuhan 430070,Hubei,China) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica napus aspartic protease collinearity analysis expression patterns RT-qPCR |
| 本文献已被 维普 等数据库收录！ |
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