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核桃 JrCOR413 基因家族鉴定与表达分析
引用本文:刘凯,李瑶玲,李洋,王红霞,赵书岗,安秀红,张志华. 核桃 JrCOR413 基因家族鉴定与表达分析[J]. 河北农业大学学报, 2022, 45(2): 14-20. DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2022.0020
作者姓名:刘凯  李瑶玲  李洋  王红霞  赵书岗  安秀红  张志华
作者单位:河北农业大学 园艺学院,河北 保定 071001;河北农业大学 山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心,河北 保定 071001,河北农业大学 生命科学学院,河北 保定 071001,河北省农林科学院 植物保护研究所,河北 保定 071001,河北农业大学 山区研究所/河北省农业工程中心/国家北方山区工程中心,河北 保定 071001
基金项目:国家重点研发计划项目(2019YFD1001603);;河北省自然科学基金资助项目(C2019204270);
摘    要:为解析核桃COR413基因家族在响应冷胁迫中的作用,本研究利用生物信息学技术在核桃全基因组筛选并鉴定COR413家族基因,对该家族成员进行结构和表达分析。结果表明,核桃COR413基因家族包含6个基因,编码7条蛋白,分布在4条染色体上,开放阅读框为549~804 bp,翻译蛋白范围为182~267个氨基酸,等电点为8.15~9.93,全部为碱性稳定蛋白;含有典型的WCOR413高度保守的结构域。聚类分析发现,该类基因可与拟南芥高度同源,并分为2个亚组。在低温胁迫48 h后经转录表达分析,JrCOR5在2个核桃品种中显著升高,并且在花器官和嫩茎转录表达较高;结合qPCR分析,JrCOR5在冷胁迫48 h显著升高,达到90倍以上。因此,推测JrCOR5可能在核桃响应冷胁迫过程中起到重要作用。本研究结果将为解析核桃JrCOR413基因家族成员在响应冷胁迫过程中的分子机制研究奠定基础。

关 键 词:核桃  冷胁迫  COR413基因家族  表达分析

Identification and expression analysis of JrCOR413 gene family in walnut
LIU Kai,LI Yaoling,LI Yang,WANG Hongxia,ZHAO Shugang,AN Xiuhong,ZHANG Zhihua. Identification and expression analysis of JrCOR413 gene family in walnut[J]. Journal of Agricultural University of Hebei, 2022, 45(2): 14-20. DOI: 10.13320/j.cnki.jauh.2022.0020
Authors:LIU Kai  LI Yaoling  LI Yang  WANG Hongxia  ZHAO Shugang  AN Xiuhong  ZHANG Zhihua
Abstract:
Keywords:
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