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拟南芥 START 结构域亚家族生物信息学分析及功能
引用本文:李晓凯,刘霞,常红娟,王凤茹.拟南芥 START 结构域亚家族生物信息学分析及功能[J].河北农业大学学报,2022,45(2):76-85.
作者姓名:李晓凯  刘霞  常红娟  王凤茹
作者单位:河北省植物生理与分子病理学重点实验室/河北农业大学真菌毒素与植物分子病理学实验室,河北 保定 071000
基金项目:河北省自然科学基金项目(C2019304421);;河北省高等学校科学技术研究项目((ZD2018085);
摘    要:START(The Steroidogenic Acute Regulatory Protein-related Lipid Transfer)结构域广泛存在于动物和植物中,参与脂质分子的转移,发挥多种生物学功能。为明确拟南芥START结构域家族成员的结构特征及功能机制,本研究以拟南芥START结构域亚家族为研究对象,通过生物信息学对该家族成员的进化关系、理化性质、基因结构、启动子顺式作用元件进行分析比较,在此基础上,通过qRT-PCR技术,对仅含START结构域亚家族成员在拟南芥发育不同组织表达特性进行了分析,通过分析仅含START结构域亚家族成员的功能获得和功能缺失的转基因拟南芥幼苗形态,确定该亚家族成员对拟南芥幼苗生长的调控作用。结果发现,拟南芥START结构域家族共有35个成员,仅含START结构域亚家族9个成员,但在进化树分析中At4g26920和At5g07260与其余7个成员不在同一分枝中,且其疏水性结合位点不同。仅含START结构域亚家族成员中仅有At3g23080不稳定系数小于40,较为稳定,多数成员均为不稳定蛋白质。基因表达分析表明仅含START结构域亚家族成员具有...

关 键 词:拟南芥  START结构域  生物信息学分析  生长发育

Bioinformatics analysis of the subfamily containing START domain and study on its function in Arabidopsis
LI Xiaokai,LIU Xia,CHANG Hongjuan,WANG Fengru.Bioinformatics analysis of the subfamily containing START domain and study on its function in Arabidopsis[J].Journal of Agricultural University of Hebei,2022,45(2):76-85.
Authors:LI Xiaokai  LIU Xia  CHANG Hongjuan  WANG Fengru
Abstract:
Keywords:
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