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装甲RNA在牡蛎中诺如病毒4种RNA提取方法比较研究中的应用
引用本文:曲梦,江艳华,李风铃,姚琳,逄凤娇,王联珠,翟毓秀. 装甲RNA在牡蛎中诺如病毒4种RNA提取方法比较研究中的应用[J]. 渔业科学进展, 2019, 40(6): 180-185
作者姓名:曲梦  江艳华  李风铃  姚琳  逄凤娇  王联珠  翟毓秀
作者单位:中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071;中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部水产品质量安全检测与评价重点实验室 青岛 266071
基金项目:国家重点研发计划;科技部科技基础性工作专项;现代农业产业技术体系
摘    要:RNA提取是诺如病毒检测的关键步骤,而目前贝类中诺如病毒RNA提取、检测方法的比较与评价常囿于缺乏量值明确、无生物安全隐患的标准样品作为参考依据。本研究将前期制备的 GⅡ型诺如病毒装甲RNA (3.0×1010拷贝)作为标准样品,人工污染牡蛎(Ostrea gigas tnunb)消化腺匀浆物,用4种常见RNA提取方法:TRIzol试剂、Viral RNA Kit、High Pure Viral Nucleic Acid Kit、柱式病毒RNAOUT试剂盒,分别提取RNA,经实时荧光RT-PCR检测后,利用标准曲线进行定量分析,分别计算4种方法对装甲RNA的回收率。结果显示,对于匀浆样本,TRIzol法对装甲RNA的回收率最高(6.80±0.89)%,显著高于Viral RNA Kit (4.51±2.28)%,二者的回收率又显著高于High Pure Viral Nucleic Acid Kit (0.24±0.05)%与柱式病毒RNAOUT试剂盒(0.11±0.02)% (P?0.05);对于冻干样本,Viral RNA Kit对装甲RNA的回收率最高(8.71±0.17)%,显著高于TRIzol试剂(7.12±0.64)%,二者的回收率又显著高于High Pure Viral Nucleic Acid Kit (0.33±0.12)%与柱式病毒RNAOUT试剂盒(0.06±0.01)% (P?0.05)。研究表明,TRIzol试剂与Viral RNA Kit对牡蛎消化腺样本中人工添加的装甲RNA均有良好的回收效果,同时也提示装甲RNA可作为一种良好的标准样品用于不同RNA提取试剂盒方法的评价与比较研究。

关 键 词:诺如病毒  装甲RNA  牡蛎  RNA提取方法  比较
收稿时间:2018-09-07
修稿时间:2018-10-31

Application of Armored RNA to Compare Four Norovirus RNA Extraction Methods in Oysters
QU Meng,JIANG Yanhu,LI Fengling,YAO Lin,PANG Fengjiao,WANG Lianzhu and ZHAI Yuxiu. Application of Armored RNA to Compare Four Norovirus RNA Extraction Methods in Oysters[J]. Progress in Fishery Sciences, 2019, 40(6): 180-185
Authors:QU Meng  JIANG Yanhu  LI Fengling  YAO Lin  PANG Fengjiao  WANG Lianzhu  ZHAI Yuxiu
Affiliation:Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071,Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071 and Yellow Sea Fisheries Research Institute, Chinese Academy of Fishery Sciences, Key Laboratory of Testing and Evaluation for Aquatic Product Safety and Quality, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Qingdao 266071
Abstract:
Keywords:Norovirus   Armored RNA   Oyster   RNA extraction method   Comparison
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