| 嗜线虫致病杆菌属Pir毒素基因克隆和生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 杨晴,张杰,李天慧,南宫自艳,王勤英.嗜线虫致病杆菌属Pir毒素基因克隆和生物信息学分析[J].中国植保导刊,2017(9):5-11. |
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| 作者姓名： | 杨晴 张杰 李天慧 南宫自艳 王勤英 |
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| 作者单位： | 1. 河北农业大学植物保护学院,河北 保定,071000;2. 河北省承德市滦平国有林场管理处,河北 滦平,068250 |
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| 基金项目： | 河北省自然科学基金(C2016204107)，河北省现代农业产业技术体系棉花创新团队(HBCT2013030201) |
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| 摘 要： | 采用基因组DNA提取法和目的基因PCR扩增对嗜线虫致病杆菌(Xenorhabdus nematophila)HB310(Xn HB310)菌株中的pirA和pirB基因进行克隆及生物信息学分析。结果表明,pirA全长408 bp,pirB全长1 290 bp;其蛋白PirA分子量为14.9 kDa,含135个氨基酸,PirB分子量为48.2 kDa,含429个氨基酸;二级结构分析表明PirA无α-螺旋,含12个β折叠,PirB含8个α螺旋和12个β折叠;亚细胞定位表明PirA和PirB主要分布在细胞核;PirA不含跨膜结构域和信号肽,PirB含有跨膜结构域和凝集素结构域,不含信号肽。
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| 关 键 词： | 嗜线虫致病杆菌 Pir毒素 基因克隆 序列分析 生物信息学分析 |
Cloning and bioinformatics analysis of Pir toxins genes from Xenorhabdus nematophila |
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| Yang Qing,Zhang Jie,Li Tianhui,Nangong Ziyan,Wang Qinying.Cloning and bioinformatics analysis of Pir toxins genes from Xenorhabdus nematophila[J].China Plant Protection,2017(9):5-11. |
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| Authors: | Yang Qing Zhang Jie Li Tianhui Nangong Ziyan Wang Qinying |
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