灭字脊虎天牛触角转录组中气味结合蛋白基因的鉴定及表达谱分析 |
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引用本文: | 吉帅帅,庄翔麟,刘乃勇.灭字脊虎天牛触角转录组中气味结合蛋白基因的鉴定及表达谱分析[J].四川农业大学学报,2018(2):193-202. |
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作者姓名: | 吉帅帅 庄翔麟 刘乃勇 |
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作者单位: | 西南林业大学生物多样性保护与利用学院;西南林业大学云南省森林灾害预警与控制重点实验室 |
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摘 要: | 【目的】发掘灭字脊虎天牛(Xylotrechus quadripes Chevrolat)成虫触角中的OBP基因,明确OBP基因在成虫不同组织的表达情况。【方法】采用Illumina HiSeq~(TM) 2000测序平台对灭字脊虎天牛的触角进行转录组测序,利用BLAST同源搜索的方法鉴定OBP基因,采用RT-PCR技术研究OBP基因的表达谱。【结果】从灭字脊虎天牛的触角转录组中共鉴定到24个OBP基因,所有OBP基因均具有全长开放阅读框(123~180个氨基酸)和信号肽序列(16~23个氨基酸)。多序列比对结果表明,不同OBP间一致性较低,其平均值为19.4%。序列比对和进化树分析结果表明,9个OBP具有6个保守的半胱氨酸,属于Classic OBPs家族;15个OBP具有4个保守的半胱氨酸,属于Minus-C OBPs家族。RT-PCR结果表明,Xqua OBP4、OBP8、OBP18和OBP21在触角特异表达;Xqua OBP2、OBP3、OBP7和OBP20在触角高表达,另外在其他组织中也有表达;其他OBPs基因在检测的两个或多个组织中均有不同程度的表达。【结论】从灭字脊虎天牛触角转录组中共鉴定得到24个OBP基因,其中部分基因在触角特异或高表达,很可能参与嗅觉功能;部分基因在非嗅觉组织中有表达,很可能具有非嗅觉功能。
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关 键 词: | 灭字脊虎天牛 触角转录组 气味结合蛋白 表达谱 |
Identification and Expression Profile Analysis of Odorant Binding Protein Genes from Xylotrechus quadripes Chevrolat (Coleoptera:Cerambycidae) |
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Abstract: | |
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