异齿裂腹鱼(Schizothorax oconnori)CLOCK蛋白结构和功能的生物信息学分析

为探讨异齿裂腹鱼CLOCK蛋白的结构、功能信息,本文通过生物信息学的方法对异齿裂腹鱼CLOCK蛋白的理化性质、亚细胞定位、跨膜区和信号肽、二级结构、三级结构、蛋白互作网络、系统进化等进行分析。异齿裂腹鱼CLOCK蛋白分子式为C_(4389)H_(6978)N_(1278)O_(1405)S_(37),相对分子量101315. 62 Da,氨基酸含量最高的是谷氨酰胺为146个,半衰期为30 h,不稳定系数为68. 37,属不稳定蛋白,理论等电点(PI)为6. 44,属于酸性蛋白质,脂肪系数为69. 96,CLOCK属于亲水性蛋白。蛋白均定位于细胞核内,不存在信号肽序列和跨膜区,存在一个核定位信号序列为KAKRVSRNKSEKKRR。异齿裂腹鱼CLOCK蛋白具有疏松的结构特征,含有111个磷酸化位点,CLOCK蛋白与多个时钟相关的蛋白互作,在物种进化上与金线鲃属鱼类CLOCK蛋白具有较高的同源性。