| 荒漠刺叶墙藓DNA的提取及PCR扩增反应条件 |
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| 引用本文： | 王红玲,张元明,吴楠,陈荣毅,聂华丽,张静.荒漠刺叶墙藓DNA的提取及PCR扩增反应条件[J].干旱区研究,2008,25(1):98-106. |
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| 作者姓名： | 王红玲 张元明 吴楠 陈荣毅 聂华丽 张静 |
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| 作者单位： | 中国科学院,新疆生态与地理研究所,新疆,乌鲁木齐,830011;中国科学院,研究生院,北京,100049;中国科学院,新疆生态与地理研究所,新疆,乌鲁木齐,830011 |
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| 基金项目： | 中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX3-SW-343)，国家自然科学基金项目(40571085,40771114)资助 |
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| 摘 要： | 采用改进CTAB法、NaOH法和直接PCR法(direct PCR amplification)提取藓类生物结皮中刺叶墙藓(Tortula desertorumBroth.)基因组DNA,比较其分离效果以及ISSR扩增效果。结果表明:改进CTAB法提取的基因组DNA质量好、纯度高,ISSR扩增反应效果好。直接PCR法一旦体系建立,则是最简易快速、经济高效的模板制备方法,适于植株矮小、生物量很小的荒漠藓类植物个体模板DNA的制备。利用改进CTAB法获得的基因组DNA作为模板,对ISSR反应组分浓度及反应程序中的一些重要参数进行摸索和优化实验,建立了刺叶墙藓最优ISSR反应体系。反应总体积为20μL,各反应组分终浓度为:2μL10×Buffer,2 mM Mg2 ,0.1 mM dNTPs,0.2μM引物,10~40 ng模板DNA,1U Taq酶。扩增程序为:94℃4 min,1个循环;94℃45 s,退火温度(Tm)45 s,72℃1 min,35个循环;72℃7 min,1个循环;4℃保存。刺叶墙藓是组成古尔班通古特沙漠藓类生物结皮的优势种,研究结果为进一步开展刺叶墙藓遗传多样性的研究奠定了基础。
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| 关 键 词： | 刺叶墙藓 DNA提取 ISSR扩增 藓类生物结皮 古尔班通古特沙漠 |
| 文章编号： | 1001-4675（2008）01-0098-09 |
| 收稿时间： | 2006-12-25 |
| 修稿时间： | 2007-01-03 |
DNA Extraction, Optimization of PCR Amplification Conditions and Selection of Primers of Tortula desertorum in Biotic Crust in the Gurbantonggut Desert |
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| WANG Hong-ling,ZHANG Yuan-ming,WU Nan,CHEN Rong-yi,NIE Hua-li,ZHANG Jing.DNA Extraction, Optimization of PCR Amplification Conditions and Selection of Primers of Tortula desertorum in Biotic Crust in the Gurbantonggut Desert[J].Arid Zone Research,2008,25(1):98-106. |
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| Authors: | WANG Hong-ling ZHANG Yuan-ming WU Nan CHEN Rong-yi NIE Hua-li ZHANG Jing |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Tortula desertorum Broth DNA extraction ISSR amplification moss biotic soil crust Gurbantonggut Desert |
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