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4种金花茶叶绿体基因组比较分析
引用本文:丁祥青,李文芳,吴丽君,陈义堂,王子墨,郑宏,郑航,邹双全.4种金花茶叶绿体基因组比较分析[J].福建农林大学学报(自然科学版),2023(3):300-308.
作者姓名:丁祥青  李文芳  吴丽君  陈义堂  王子墨  郑宏  郑航  邹双全
作者单位:1. 福建农林大学园林学院;2. 福建农林大学林学院;3. 福建省洋口国有林场;4. 福州植物园;5. 自然生物资源保育利用福建省高校工程技术研究中心
基金项目:福建省林业科技项目(2021FKJ24);
摘    要:利用全基因组重测序数据组装得到了夏石金花茶等4种金花茶的叶绿体全基因组序列,并进行了注释和比较分析.结果表明,4种金花茶植物叶绿体基因组序列高度相似,约为156 657~157 046 bp,均预测注释134个基因,包含89个蛋白编码基因、8个rRNA和37个tRNA;金花茶植物的叶绿体基因组在结构和进化上具有保守性,它们具有相似的密码子偏好性且均未发生大面积的倒位和基因重排;通过叶绿体基因组的比较分析和核苷酸多态性分析发掘了rps16和ycf1等高变异片段,这些片段可作为金花茶植物的分子标记;基于金花茶叶绿体基因组数据构建的系统进化树具有较高的支持度,说明金花茶叶绿体基因组序列的公布对其系统发育的研究具有重要意义.

关 键 词:金花茶植物  叶绿体基因组  密码子偏好性  多态性分析  分子标记  SSR  系统发育分析
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