| 圆齿野鸦椿Hsp20基因家族鉴定及功能分析 |
| |
| 引用本文： | 李一凡,丁乐,陈淑颖,曾姣艳,蔡丽娟,邹双全.圆齿野鸦椿Hsp20基因家族鉴定及功能分析[J].福建农林大学学报(自然科学版),2023(2):211-221. |
| |
| 作者姓名： | 李一凡 丁乐 陈淑颖 曾姣艳 蔡丽娟 邹双全 |
| |
| 作者单位： | 1. 福建农林大学林学院;2. 自然生物资源保育利用福建省高校工程技术研究中心;3. 福州外语外贸学院 |
| |
| 基金项目： | 福建省本科高校教改研究项目(FBJG20210077)； |
| |
| 摘 要： | 为了探究圆齿野鸦椿Hsp20基因在强光、高温胁迫中的作用，利用生物信息学的方法对圆齿野鸦椿Hsp20基因家族进行全基因组鉴定，并从理化性质、系统进化、保守基序及基因结构、染色体定位及物种间共线性、顺式作用元件预测、蛋白网络互作和表达模式等方面进行分析.结果表明：圆齿野鸦椿含有32个Hsp20基因，分布在9条染色体中，分为5个大家族和12个亚家族，多数基因有1个内含子.EkHsp20家族的主要扩增方式为片段复制.圆齿野鸦椿含有多个非生物胁迫响应元件和激素类响应元件，如光响应元件、脱落酸响应元件等.表达量分析结果表明，圆齿野鸦椿Hsp20基因与Hsp101基因有蛋白网络互作关系.ER家族是一类提高植株的抗冷性的基因，圆齿野鸦椿基因组中缺失ER基因家族，这可能与其不耐寒相关.根据高温、持续强光导致叶片蜷缩的现象，结合EkHsp20-04、EkHsp20-20、EkHsp20-25在系统发育树中与拟南芥Hsp17.6b聚合在一起、与拟南芥Hsp101呈现蛋白互作关系，且均为CⅠ家族成员，推测EkHsp20-20、EkHsp20-04、EkHsp20-25可能是促使圆齿野鸦椿在高温条件下产生自我...
|
| 关 键 词： | 圆齿野鸦椿 Hsp20 生物信息学 基因家族 |
|
|
