基于RNA-Seq探究蔗糖影响黑果枸杞枝刺发生的机理 |
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引用本文: | 乔杨,刘雯,李璐佳,孙丽丽,王钦美.基于RNA-Seq探究蔗糖影响黑果枸杞枝刺发生的机理[J].经济林研究,2024(1):126-139. |
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作者姓名: | 乔杨 刘雯 李璐佳 孙丽丽 王钦美 |
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作者单位: | 1. 沈阳农业大学林学院;2. 沈阳农业大学辽宁省林木遗传育种与培育重点实验室;3. 长春吉大附中实验学校 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(32171831);;辽宁省自然科学基金项目(2023-MS-207); |
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摘 要: | 【目的】黑果枸杞Lycium ruthenicum是集生态、经济和药用价值等为一体的灌木。然而,其密集的枝刺严重阻碍其作为经济林推广,本研究旨在探究蔗糖(Suc)促进黑果枸杞(黑杞)枝刺的发生机理,为培育其无刺优良品种提供依据。【方法】在证明Suc通过能量和信号路径促进黑杞枝刺发生的基础上,利用RNA-Seq对无刺茎顶芽(TleCK)、有刺茎顶芽(ThoCK)、黑暗处理的有刺茎顶芽(ThoDCK)、减少内源Suc处理后有刺变无刺茎顶芽(TleDPL)和喷施外源Suc后无刺变有刺茎顶芽(ThoSuc)5种样品的差异表达基因(DEG)和叶绿体差异基因(cpDEG)进行筛选和分析,并采用RT-qPCR验证了9个DEG的表达情况。【结果】5组有刺和无刺材料顶芽之间(ThoCK vs. TleCK、ThoCK vs. TleDPL、ThoDCK vs. TleDPL、TleCK vs. ThoSuc和TleDPL vs. ThoSuc)的DEG分别为5 281、4 363、3 125、5 226和3 278个,这5组DEG共同显著富集在9个GO条目和4个KEGG通路(“类黄酮生物合成”“二萜生物...
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关 键 词: | 黑果枸杞 顶芽 枝刺 RNA-Seq 蔗糖 |
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