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犬瘟热疫苗株CDV3核蛋白基因全序列测序及分析
引用本文:王凤雪,闫喜军,柴秀丽,张海玲,邵西群,罗国良,赵建军.犬瘟热疫苗株CDV3核蛋白基因全序列测序及分析[J].特产研究,2007,29(4):7-10.
作者姓名:王凤雪  闫喜军  柴秀丽  张海玲  邵西群  罗国良  赵建军
作者单位:中国农业科学院特产研究所,吉林,吉林,132109
基金项目:科技部社会公益研究项目
摘    要:根据GenBank上发表的犬瘟热病毒(CDV)核蛋白(N)蛋白基因序列,设计合成了1对寡聚核苷酸引物,提取犬瘟热病毒疫苗株CDV3的RNA为模板,采用RT-PCR扩增病毒的N蛋白基因,并进行产物克隆和序列分析。将CDV3疫苗株N基因与GenBank数据库中的疫苗株Onderstepoort及中国、美国和德国等分离的疫苗株或毒株共14株CDV N基因序列进行同源性分析,发现CDV3 N基因序列与疫苗株Onderstepoort的同源性为97.1%,与其他分离毒株的核苷酸同源性为92.8%~94.0%,其中与中国分离的TN株同源性为93.6%;然而,CDV3 N蛋白与它们的氨基酸同源性却基本都为96.6%~97.3%。这说明虽然犬瘟热弱毒株CDV3在核苷酸水平上与其他疫苗株毒株的差异较大,但是在氨基酸水平上的比较差异较小。

关 键 词:犬瘟热病毒  N基因  序列分析  同源性
文章编号:1001-4721(2007)04-0007-04
收稿时间:2007-08-29
修稿时间:2007年8月29日

Sequence Analysis of Nucleocaspid Protein Gene of Vaccine Strain of Canine Distemper Virus
WANG Feng-Xue,YAN Xi-Jun,CHAI Xiu-Li,ZHANG Hai-ling,SHAO Xi-Qun,LUO Guo-liang,ZHAO Jian-jun.Sequence Analysis of Nucleocaspid Protein Gene of Vaccine Strain of Canine Distemper Virus[J].Special Wild Economic Animal and Plant Research,2007,29(4):7-10.
Authors:WANG Feng-Xue  YAN Xi-Jun  CHAI Xiu-Li  ZHANG Hai-ling  SHAO Xi-Qun  LUO Guo-liang  ZHAO Jian-jun
Abstract:
Keywords:Canine Distemper Virus  Nucleocaspid protein gene  Sequence analysis  Homology
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