陆地棉硝酸盐转运体NRT基因家族鉴定及表达分析

硝酸盐转运体(nitrate transporters, NRTs)在植物氮素吸收、利用和存储等过程中发挥着重要作用。本研究利用HMM软件和Blastp方法,在陆地棉中,鉴定出了106个GhNRT1/PTR (NPF)(Nitrate transporter 1 (NRT1)/Peptide Transporter(PTR)family(NPF))和14个GhNRT2(Nitrate transporter2family)成员,对它们的保守结构域、系统发育关系、理化性质、亚细胞定位、保守基序、基因结构、启动子区顺式作用元件和表达模式进行了分析。结果表明, GhNPF均具有典型的PTR2(Peptide Transporter 2family,肽转运蛋白)结构域,个别蛋白(GhNPF2.6bD、GhNPF4.1cA和GhNPF2.14aD)出现了2个PTR2和/或其他结构域,表明棉花NPF进化保守性较低;GhNRT2具有典型的MFS＿1(Major Facilitator Superfamily,主要促进子超家族)单域。多数GhNRTs定位于细胞质膜上,为疏水性蛋白。系统发育分析显示Gh...