| 初步探究LncRNA在甘蓝型油菜生态型分化中的作用 |
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| 引用本文： | 杨太桦,杨福权,郜耿东,殷帅,金庆东,徐林珊,蒯婕,汪波,徐正华,葛贤宏,王晶,周广生.初步探究LncRNA在甘蓝型油菜生态型分化中的作用[J].作物学报,2023(5):1197-1210. |
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| 作者姓名： | 杨太桦 杨福权 郜耿东 殷帅 金庆东 徐林珊 蒯婕 汪波 徐正华 葛贤宏 王晶 周广生 |
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| 作者单位： | 华中农业大学植物科学技术学院 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目“大田经济作物优质丰产的生理基础与调控”(2018YFD1000900)资助~~； |
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| 摘 要： | 甘蓝型油菜是我国重要的油料作物之一,根据其成花转变过程中对低温春化时间需求的不同分为3种生态型:春性、半冬性和冬性。前人研究发现,长链非编码RNA (LncRNA)可在多层面上调控基因的表达,参与对植物生长发育的调控。在拟南芥中, LncRNA可以通过调控春化途径相关基因的表达来影响开花。本研究以3种生态型甘蓝型油菜为材料,利用高通量测序技术进行苗期叶片的mRNA和LncRNA测序,初步探究LncRNA在油菜生态型分化及适应性形成中的作用。3种生态型甘蓝型油菜共差异表达基因的GO及KEGG富集分析表明,不同生态型甘蓝型油菜之间存在大量基础化合物合成代谢差异,特别是脂质类化合物。3种生态型甘蓝型油菜中共鉴定获得3775个LncRNA,其中285个在2个及以上生态型组合中存在差异表达,涉及到1517个候选靶基因。这些差异表达LncRNA涉及到的靶基因也富集到大量基础化合物合成代谢途径。通过mRNA-LncRNA联合分析,我们预测到了一个开花基因的调控网络,包含8个开花基因和23个LncRNA,涉及到温度和光信号调控通路。通过比较鉴定得到的LncRNA和972个甘蓝型油菜重要农艺性状QTL位...
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| 关 键 词： | 甘蓝型油菜 生态型 长链非编码RNA 开花基因 农艺性状位点 |
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