| 基于干旱胁迫转录组信息的蚕豆ASPAT基因家族分析 |
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| 引用本文： | 魏正欣,刘昌燕,陈宏伟,李莉,孙龙清,韩雪松,焦春海,沙爱华.基于干旱胁迫转录组信息的蚕豆ASPAT基因家族分析[J].作物学报,2023(7):1871-1881. |
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| 作者姓名： | 魏正欣 刘昌燕 陈宏伟 李莉 孙龙清 韩雪松 焦春海 沙爱华 |
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| 作者单位： | 1. 长江大学农学院/湿地生态与农业利用教育部工程研究中心;2. 湖北省农业科学院粮食作物研究所/粮食作物种质创新与遗传改良湖北省重点实验室 |
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| 基金项目： | 国家重点研发计划项目(2019YFD1001303/2019YFD1001300)；;财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-08)； |
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| 摘 要： | 蚕豆(Vicia faba L.)是一种重要的食用豆作物,干旱会导致蚕豆产量降低。鉴定蚕豆耐旱基因,有利于通过分子标记辅助育种和基因工程手段培育抗旱品种。在前期研究中,我们通过转录组测序鉴定出了一类天冬氨酸转氨酶基因(ASPAT)响应蚕豆干旱胁迫。ASPAT催化天冬氨酸(ASP)和α-酮戊二酸的可逆转氨反应,生成草酰乙酸和谷氨酸,是参与植物体代谢的关键酶。本文基于转录组测序数据,通过生物信息学方法全基因组鉴定了蚕豆ASPAT基因家族成员,并分析了各基因家族成员的理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白结构域、保守基序、系统进化、蛋白质互作和基因表达模式。结果显示,蚕豆转录参考基因组中共有8个ASPAT基因家族成员,包括3个真核型ASPAT(AAT)基因和5个原核型ASPAT(PAT)基因,分别定位于线粒体和叶绿体。系统发育分析表明,蚕豆ASPAT蛋白主要可分为2个亚族Iα和Iβ。Iα为AAT蛋白,包括VfASPAT1～VfASPAT3。Iβ为PAT蛋白,包括VfASPAT4～VfASPAT8。蚕豆ASPAT家族成员均含有motif1、motif3、motif9,且具有相似的基因结构和共同的...
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| 关 键 词： | 蚕豆 天冬氨酸转氨酶 基因家族 干旱胁迫 基因表达 |
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