甘蓝型油菜SGR基因家族的全基因组鉴定与功能分析 |
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引用本文: | 唐玉凤,姚敏,何昕,官梅,刘忠松,官春云,钱论文.甘蓝型油菜SGR基因家族的全基因组鉴定与功能分析[J].作物学报,2023(7):1829-1842. |
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作者姓名: | 唐玉凤 姚敏 何昕 官梅 刘忠松 官春云 钱论文 |
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作者单位: | 湖南农业大学农学院/南方粮油作物协同创新中心 |
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基金项目: | 国家自然科学基金项目(31801399);;湖南省教育厅科学研究重点项目(21A0135)资助~~; |
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摘 要: | 叶绿素是植物进行光合作用的一类绿色色素,对植物生长有着直接的影响。本研究利用生物信息学方法在全基因组水平上对甘蓝型油菜(Brassica napus)、白菜(Brassica rapa)、甘蓝(Brassica oleracea)和拟南芥(Arabidopsis thaliana)中滞绿基因(STAY-GREEN,SGR)家族成员进行分析发现,28个SGR基因大多数包含4个外显子,编码碱性蛋白。染色体定位和共线性分析显示,甘蓝型油菜SGR基因家族成员中不存在串联复制,SGR基因家族成员之间具有线性关系,高度同源,且在进化过程中非常保守。此外,利用60K SNP对203份半冬性甘蓝型油菜自交系的叶绿素含量进行全基因组关联分析(Genome-wide association study,GWAS),检测到2个单体型区域Chr.A01:6,193,165~6,317,757 bp和Chr.C01:9,059,861~9,906,618 bp携带的Bna SGR1a-A01和Bna SGR1-C01与叶绿素含量显著相关。同时,结合50份半冬性甘蓝型油菜重测序数据,对这2个单体型进行进区域关联分...
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关 键 词: | 甘蓝型油菜 SGR基因 全基因组关联分析 叶绿素含量 |
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