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水牛ACSL基因家族全基因组及表达分析
引用本文:梁莎莎,于农淇,鄢胜飞,卢瑛,李厅厅,黄健,谭正准,李辉,黄荣春,潘伟军,覃广胜.水牛ACSL基因家族全基因组及表达分析[J].安徽农业科学,2023(14):79-85+135.
作者姓名:梁莎莎  于农淇  鄢胜飞  卢瑛  李厅厅  黄健  谭正准  李辉  黄荣春  潘伟军  覃广胜
作者单位:中国农业科学院广西水牛研究所/广西水牛遗传繁育重点实验室
基金项目:广西自然科学基金项目(2022GXNSFAA035588);;国家现代农业产业技术体系广西奶水牛产业创新团队项目(nycytxgxcxtd-2021-21-01);
摘    要:为鉴定水牛长链脂酞辅酶A合成酶(long-chain fatty Acyl-CoA synthetases,ACSLs)的家族成员并探究该基因家族在泌乳方面的功能,通过生物信息学技术对水牛ACSL基因家族进行了motif、基因结构分析、共线性分析、不同物种系统进化分析,运用qPCR技术检测ACSLs在不同组织的mRNA表达量。结果表明:水牛ACSL基因家族共有5个家族成员并分别命名为bbu.ACSL1、bbu.ACSL3、bbu.ACSL4、bbu.ACSL5和bbu.ACSL6。染色体分布情况结果显示:bbu.ACSL1位于1号染色体,bbu.ACSL3位于2号染色体,bbu.ACSL4位于25号染色体,bbu.ACSL5位于23号染色体,bbu.ACSL6位于9号染色体。这5个ACSL氨基酸数在699~722 aa,所有蛋白的等电点除ACSL6外均大于7.00。Motif分析发现,除ACSL3和ACSL4缺少motif8外,其余均含有预测出的Motif 1~10,且排序相同。物种内共线性分析结果显示,水牛和普通牛中均不存在串联重复和片段重复,种间共线性分析结果显示,水牛ACSL与普...

关 键 词:水牛  ACSL  基因结构  共线性  系统发育  乳腺组织  表达量
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