基于SSR标记的42份樱花品种的聚类分析及DNA指纹图谱构建 |
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引用本文: | 孙泽硕,蒋冬月,柳新红,沈鑫,李因刚,屈雨飞,李永华.基于SSR标记的42份樱花品种的聚类分析及DNA指纹图谱构建[J].园艺学报,2023(3):657-668. |
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作者姓名: | 孙泽硕 蒋冬月 柳新红 沈鑫 李因刚 屈雨飞 李永华 |
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作者单位: | 1. 河南农业大学风景园林与艺术学院;2. 浙江省林业科学研究院;3. 浙江农林大学林业与生物技术学院 |
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基金项目: | 国家自然科学基金青年基金项目(32101585); |
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摘 要: | 通过14对SSR引物基于UPGMA法对42份樱花品种进行聚类分析,并采用引物和基因型组合法构建DNA指纹图谱。结果表明:14对SSR引物共检测出187个等位基因,每对引物平均13.36个,有效等位基因平均6.10个,观察杂合度平均0.31,期望杂合度平均0.80,Shannon’s信息指数平均2.01,多态信息含量平均0.77;共检测出219个基因型,平均15.64个,平均区分率为22.11%。在Dice遗传相似系数约为0.18处时可分为3组,A组主要是山樱系、豆樱系和江户彼岸樱系的品种,B组是钟花樱系的品种,C组中只有尾叶樱;当Dice遗传相似系数约为0.37时,除八重红枝垂樱外,A组又可以分为6个小组。采用引物和基因型组合法构建了42份樱花品种的DNA指纹图谱,为今后樱花品种资源的分子鉴定提供依据。
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关 键 词: | 樱花 SSR 品种 聚类分析 DNA指纹图谱 |
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