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基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发
引用本文:郁永明,田丹青,潘晓韵,金亮,葛亚英. 基于红掌转录组序列的SSR标记分析与开发[J]. 分子植物育种, 2015, 0(6)
作者姓名:郁永明  田丹青  潘晓韵  金亮  葛亚英
作者单位:浙江省农科院花卉研究开发中心,杭州,311202
基金项目:浙江省自然科学基金,浙江省花卉育种专项,杭州市重大科技创新专项,杭州市种子种苗项目
摘    要:本研究从红掌转录组共32 391条unigenes中搜索得到3 944个SSR位点,出现频率为12.17%。EST-SSR类型以一、二、三核苷酸重复为主,占总SSR比例的96.29%,其中二核苷重复为主要基序类型,占总SSR的51.01%,AG/CT重复类型出现最多。设计合成的200对SSR引物中有22对引物扩增条带清晰、多态性好,在18个红掌品种中得到有效性验证。结果表明,基于红掌转录组序列的SSR标记开发是可行的,这些EST-SSR的开发可为红掌遗传多样性分析、分子育种等奠定重要基础。

关 键 词:红掌  转录组  SSR  引物

Mining and Developing SSR Molecular Markers Based on Transcriptome Sequences of Anthurium
Yu Yongming,Tian Danqing,Pan Xiaoyun,Jin Liang,Ge Yaying. Mining and Developing SSR Molecular Markers Based on Transcriptome Sequences of Anthurium[J]. Molecular Plant Breeding, 2015, 0(6)
Authors:Yu Yongming  Tian Danqing  Pan Xiaoyun  Jin Liang  Ge Yaying
Abstract:
Keywords:
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