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牡丹长链脂酰辅酶A合成酶基因PsLACS的克隆及生物信息学分析
引用本文:刘春英,李方正,张玉喜,卢向阳. 牡丹长链脂酰辅酶A合成酶基因PsLACS的克隆及生物信息学分析[J]. 分子植物育种, 2015, 0(6)
作者姓名:刘春英  李方正  张玉喜  卢向阳
作者单位:1. 湖南农业大学生物科学技术学院,湖南省农业生物工程研究所,长沙,410128; 青岛农业大学生命科学学院,山东省高校植物生物技术重点实验室,青岛,266109
2. 青岛农业大学动物科学学院,青岛,266109
3. 青岛农业大学生命科学学院,山东省高校植物生物技术重点实验室,青岛,266109
4. 湖南农业大学生物科学技术学院,湖南省农业生物工程研究所,长沙,410128
基金项目:山东省自然基金青年基金项目
摘    要:根据本实验室前期获得的长链脂酰辅酶A基因的EST序列设计引物,本研究利用RACE扩增从牡丹中得到2 377 bp的Ps LACS全长c DNA,其中,包括5'UTR 347 bp,3'UTR 200 bp和1 830 bp的编码区,共编码609个氨基酸,分子量为67.94 k D。Ps LACS包括30个可能的磷酸化位点,其中14个位于丝氨酸(S),7个位于苏氨酸(T),9个位于酪氨酸(Y),这可能与酶活性的调节有关。二级结构预测显示,Ps LACS含α-螺旋和无规则卷曲较多。同源性分析结果表明,Ps LACS与葡萄LACS同源性最高,其次是橙子LACS、蓖麻LACS。系统进化树分析结果与同源性比对的结果基本一致。研究结果可为进一步研究牡丹Ps LACS基因的功能提供了理论基础。

关 键 词:牡丹(Paeonia suffruticosa Andr.)  PsLA CS  RACE扩增  生物信息学

Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Ps LACS Gene from Tree Peony (Paeonia suffruticosa)
Liu Chunying,Li Fangzheng,Zhang Yuxi,Lu Xiangyang. Molecular Cloning and Bioinformatics Analysis of Ps LACS Gene from Tree Peony (Paeonia suffruticosa)[J]. Molecular Plant Breeding, 2015, 0(6)
Authors:Liu Chunying  Li Fangzheng  Zhang Yuxi  Lu Xiangyang
Abstract:
Keywords:Tree peony (Paeonia suffruticosa Andr.)  PsLA CS  RACE amplification  Bioinformatics
本文献已被 CNKI 万方数据 等数据库收录!
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