| 小鼠中年期和老年期睾丸组织转录组分析 |
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| 引用本文： | 张 涛,杨理凯,路宏朝,王 令,刘 欢,左甜甜. 小鼠中年期和老年期睾丸组织转录组分析[J]. 西北农业学报, 2018, 27(8): 1088-1096 |
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| 作者姓名： | 张 涛 杨理凯 路宏朝 王 令 刘 欢 左甜甜 |
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| 作者单位： | 陕西理工大学生物科学与工程学院 |
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| 基金项目： | 陕西理工大学人才启动项目（SLGQD2017-10）；陕西省科技厅农业科技创新与攻关（2016NY-084）。 |
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| 摘 要： | 为丰富小鼠睾丸组织转录组研究领域的基础数据,对中年期(180日龄)和老年期(360日龄)小鼠睾丸组织进行转录组测序分析,在中、老年期分别获得25 187 980个和28 840 576个可用Reads,比对到参考基因组上的Reads分别有18 861 721和22 355 657个,占总读数的74.88%和77.51%,并检测到中、老年期小鼠睾丸组织中分别有17 770和18 073个基因表达。以中年期为对照,老年期睾丸组织中下调基因122个,上调基因185个,其中可清楚注释的基因共285个。GO分析发现285个差异表达被归纳到生物过程、细胞组分与分子功能3个大类的25个小类,主要涉及膜、氧化还原过程、转运蛋白活性、生殖发育及衰老等。KEGG分析发现差异表达基因涉及139个信号通路,主要代谢通路为信号转导、脂代谢、碳水化合物代谢、内分泌系统和神经系统等生物学机制。差异表达基因中RPKM1的有57个,其所涉及信号通路主要为脂代谢、固醇类激素生成、TNF信号通路、补体系统、胰岛素和溶酶体等。
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| 关 键 词： | 小鼠；睾丸；转录组；差异表达基因；功能分类 |
Transcriptome Analysis of Mouse Testis Tissue in Middle Age and Old Age |
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| ZHANG Tao,YANG Likai,LU Hongzhao,WANG Ling,LIU Huan and ZUO Tiantian. Transcriptome Analysis of Mouse Testis Tissue in Middle Age and Old Age[J]. Acta Agriculturae Boreali-occidentalis Sinica, 2018, 27(8): 1088-1096 |
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| Authors: | ZHANG Tao YANG Likai LU Hongzhao WANG Ling LIU Huan ZUO Tiantian |
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