空心莲子草SOD基因家族鉴定和表达模式分析 |
| |
引用本文: | 韩硕,韩晓文,胡义锋,陈中义,朱永兴,尹军良.空心莲子草SOD基因家族鉴定和表达模式分析[J].草业学报,2024(1):102-116. |
| |
作者姓名: | 韩硕 韩晓文 胡义锋 陈中义 朱永兴 尹军良 |
| |
作者单位: | 1. 长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心;2. 长江大学农学院;3. 中南民族大学生命科学学院;4. 长江大学园艺园林学院 |
| |
摘 要: | 超氧化物歧化酶(SOD)是一类保守的抗氧化酶,在植物生长发育和胁迫应答响应过程中发挥重要作用。目前,尚缺乏对空心莲子草SOD家族成员的系统认识。本研究通过生物信息学对空心莲子草SOD基因家族进行了系统的鉴定及分析,并对其理化性质、保守基序、基因结构、系统发育进化关系、miRNA靶向关系和表达模式等进行了分析。结果表明,在空心莲子草中共鉴定到43个ApSOD,其中22个属于Cu/ZnSOD亚家族,21个属于Fe/MnSOD亚家族;蛋白质特征分析表明,36个ApSOD蛋白为亲水蛋白,37个ApSOD蛋白为稳定蛋白;亚细胞定位预测发现,大部分Cu/ZnSOD定位在叶绿体或细胞质,大多数Fe/MnSOD定位在线粒体。保守结构域分析发现,同亚家族中的成员具有相似的保守基序与基因结构。miRNA靶向关系预测发现,17个空心莲子草miRNA通过切割或翻译抑制作用靶向14个ApSODs。表达模式分析发现,ApSODs在不同环境条件和组织中表达水平相对稳定。利用RT-qPCR分析了6个ApSODs在除草剂处理下的表达模式,结果表明,在噁草酮和氯氟吡氧乙酸胁迫下,6个ApSODs在药后7 d内显著上调表达...
|
关 键 词: | 超氧化物歧化酶 空心莲子草 表达模式分析 除草剂 |
|
|