Class Ⅰ新城疫病毒NP因分子特征的研究 |
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作者姓名: | 刘晓文 吴双 胡顺林 王晓泉 刘慧谋 刘秀梵 |
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作者单位: | 扬州大学兽医学院农业部畜禽传染病学重点开放实验室,江苏扬州,225009 |
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摘 要: | 为分析2002~2007年Class Ⅰ新城疫病毒分离株NP基因的分子特征,以及其在新城疫病毒演化过程中所起的作用,采用RT-PCR方法扩增分离株的核衣壳蛋白(NP)基因,并进行了测序,应用生物信息学软件分析NDV NP基因的分子特征.根据NP基因序列的遗传发生分析表明,Class Ⅰ NDV 2型毒株与DE/R49-99和美国株亲缘关系较近,而3型毒株与其他Class Ⅰ毒株遗传关系较远,具有地区特色,形成一个独立的分支.生物信息学软件分析表明,NP蛋白N端1~400氨基酸比较保守,而C端序列(特别是氨基酸残基400~480)高度变异.ClaSs Ⅰ病毒2型毒株与国外分离株亲缘关系较近,可能有共同的起源;而3型毒株独立于其他Class Ⅰ毒株,具有独特性,这两种毒株的来源不同;不同基因型NP蛋白之间比较保守,但是P蛋白的C端发生了多个氨基酸的变异,对其功能的影响还需进一步探讨.
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关 键 词: | 新城疫病毒 class Ⅰ和Class Ⅱ 核蛋白基因 发生分析 |
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