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马铃薯StCDPKs基因家族成员鉴定与表达分析
作者姓名:洪旭升  李世贵  杨江伟  罗红玉  张宁  司怀军
作者单位:1. 甘肃农业大学生命科学技术学院;2. 甘肃农业大学农学院;3. 甘肃省干旱生境作物学省部共建国家重点实验室培育基地
基金项目:国家自然科学基金项目(31660416);
摘    要:【目的】通过对马铃薯StCDPKs基因家族成员的鉴定与表达模式分析,初步阐明该基因家族在马铃薯胁迫响应中的功能.【方法】用隐马尔科夫模型鉴定马铃薯StCDPKs基因家族成员,MEGA6.0构建StCDPKs蛋白序列的系统进化树,qRT-PCR分析StCDPKs基因在组织特异性和盐胁迫下的表达情况.【结果】本研究共鉴定出27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,它们均包含CDPKs蛋白钙离子结合域最保守的结构域EF-hand;其中StCDPK2/421/22/25基因在马铃薯不同组织中表达差异显著,StCDPK8/10/11/18/22基因在盐胁迫下表达量明显升高.【结论】共鉴定获得27个马铃薯StCDPKs基因家族成员,其中StCDPK8/10/11/18/22基因与马铃薯响应盐胁迫相关,研究结果可为进一步阐明马铃薯StCDPKs基因的功能提供基础.

关 键 词:马铃薯  StCDPK基因  基因鉴定  盐胁迫  表达分析
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