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绵羊UCP1基因碱基突变与其蛋白结构和功能
引用本文:袁亚男,刘文忠,刘建华,乔利英,武建亮.绵羊UCP1基因碱基突变与其蛋白结构和功能[J].中国农业科学,2012,45(14):2973-2980.
作者姓名:袁亚男  刘文忠  刘建华  乔利英  武建亮
作者单位:山西农业大学动物科技学院,山西太谷 030801
基金项目:国家自然科学基金,山西省研究生优秀创新项目
摘    要:【目的】检测两个绵羊群体中解偶联蛋白1(uncoupling protein 1,UCP1)基因的单核苷酸多态性 (single nucleotide polymorphism,SNP),预测和分析碱基改变对蛋白结构和功能的影响。【方法】利用PCR-SSCP结合测序的方法检测UCP1基因编码区的SNPs,用生物信息学方法分析UCP1蛋白的理化性质和结构。【结果】UCP1基因编码区存在4个SNPs,其中c.214G>A(Val72Met)和c.273C>T位于外显子2,c.624C>T和c.757G>A(Ala253Thr)位于外显子5。进一步分析导致氨基酸改变的c.214G>A和c.757 G>A突变发现,此两个突变只对UCP1蛋白的理化性质和转录因子结合位点有细微改变,未引起UCP1蛋白空间构象的变化,对蛋白表达的影响不大。【结论】基于对人类中两个与肥胖相关的外显子突变型蛋白结构的比较说明,UCP1蛋白结构的改变可能影响其功能。

关 键 词:绵羊    解偶联蛋白1(UCP1)    单核苷酸多态性(SNP)    生物信息学    蛋白结构
收稿时间:2011-11-17

The Base Mutation of Ovine UCP1 Gene and Its Relationship with Protein Structure and Function
YUAN Ya-nan , LIU Wen-zhong , LIU Jian-hua , QIAO Li-ying , WU Jian-liang.The Base Mutation of Ovine UCP1 Gene and Its Relationship with Protein Structure and Function[J].Scientia Agricultura Sinica,2012,45(14):2973-2980.
Authors:YUAN Ya-nan  LIU Wen-zhong  LIU Jian-hua  QIAO Li-ying  WU Jian-liang
Institution:(College of Animal Science and Technology,Shanxi Agricultural University,Taigu 030801,Shanxi)
Abstract:
Keywords:sheep  uncoupling protein 1(UCP1)  single nucleotide polymorphism(SNP)  bioinformatics  protein structure
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