| 烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析 |
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| 引用本文： | 龚达平,解敏敏,孙玉合. 烟草叶片全长cDNA文库构建及EST序列分析[J]. 中国农业科学, 2012, 45(9): 1696-1702. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.09.004 |
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| 作者姓名： | 龚达平 解敏敏 孙玉合 |
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| 作者单位： | 1.中国农业科学院烟草研究所/中国农业科学院烟草遗传改良与生物技术重点开放实验室，山东青岛266101 |
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| 基金项目： | 国家烟草专卖局项目，国家烟草专卖局项目 |
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| 摘 要： | 【目的】构建烟草叶片全长cDNA文库并测序，发掘与烟叶发育、代谢和抗逆相关的基因，为进一步研究功能基因奠定基础。【方法】以烟草苗期叶片为试验材料，利用改进的Cap-trapper法构建烟草叶片全长cDNA文库。利用测序技术获得大量的EST序列，采用生物信息分析手段，对所测EST进行拼接和功能注释。【结果】构建了烟草叶片的全长cDNA文库，该文库滴度为1.2×106 pfu•mL-1，平均插入片段在1.4 kb左右。利用该文库测序了5 280个克隆，获得5 233条高质量表达序列标签（EST），序列拼接出3 922个单一基因；同源比对分析表明，89.7%的基因与已知功能基因具有较高的同源性，这些基因涉及细胞生长、信号转导、翻译合成、抗逆反应和能量代谢等功能；并详细鉴定了部分与烟碱合成和抗病相关的基因。【结论】通过Cap-trapper法成功构建了高质量的烟草幼苗叶片全长cDNA文库；大规模EST测序分析挖掘到大量与烟草幼苗叶片发育、抗逆、抗病、烟碱代谢相关的侯选基因。
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| 关 键 词： | 烟草 全长cDNA文库 表达序列标签 功能注释 |
| 收稿时间： | 2011-10-20 |
Construction and Sequences Analysis of Full-Length cDNA Library of Tobacco Leaves |
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| GONG Da-ping , XIE Min-min , SUN Yu-he. Construction and Sequences Analysis of Full-Length cDNA Library of Tobacco Leaves[J]. Scientia Agricultura Sinica, 2012, 45(9): 1696-1702. DOI: 10.3864/j.issn.0578-1752.2012.09.004 |
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| Authors: | GONG Da-ping XIE Min-min SUN Yu-he |
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| Affiliation: | (Institute of Tobacoo Research,Chinese Academy of Agricultural Sciences/Key Laboratory of Tobacco Genetic Improvement and Biotechnology,Chinese Academy of Agricultural Sciences,Qingdao 266101,Shandong) |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | tobacco full-length cDNA library EST function annotation |
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