| 麝香百合液泡膜水孔蛋白基因LlTIP2的克隆及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 李红梅,丁岳炼,林燕飞,陈伟文,黄新敏,何生根. 麝香百合液泡膜水孔蛋白基因LlTIP2的克隆及生物信息学分析[J]. 热带作物学报, 2011, 32(10): 1868-1872 |
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| 作者姓名： | 李红梅 丁岳炼 林燕飞 陈伟文 黄新敏 何生根 |
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| 作者单位： | 仲恺农业工程学院生命科学学院,广东广州,510225 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31071829,30771519); 广东省自然科学基金项目(10151022501000035,8251022501000002) |
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| 摘 要： | 水孔蛋白是位于质膜和液泡膜等生物膜上主要负责水分跨膜运输的通道蛋白,属于膜主要内在蛋白(major intrinsic proteins,MIP)超家族.采用RT-PCR和RACE法从麝香百合(Lilium longiflorum)叶片克隆得到1个液泡膜内在蛋白(tonoplast intrinsic proteins,TIPs)基因的全长cDNA序列,命名为LTIP2(GenBank登录号:JN085950).该基因cDNA全长986 bp,包括208bp的3’-非翻译区,744 bp开放阅读框以及34 bp的5’-非翻译区,共编码247个氨基酸.由L1TI P2推导的氨基酸序列具有2个高度保守的水孔蛋白NPA (Asn-Pro-Ala)基序以及MIP的特征序列SGGHVNPAVTFG.同源性分析表明,LITIP2氨基酸序列与陆地棉(Gossypium hirsutum)、大麦(Hordeum vulgare)、黑麦草(Lolium perenne)和小麦(Triticum aestivum)等植物TIP2的同源性分别达77％、74％、73％和72％.系统进化树分析表明LlTIP2属于液泡膜水孔蛋白TIP2亚类新成员.
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| 关 键 词： | 麝香百合 水孔蛋白 液泡膜内在蛋白 基因克隆 序列分析 |
Cloning and Bioinformatics Analysis of a Tonoplast Aquaporin Gene LlTIP2 in Lilium longiflorum |
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| LI Hongmei , DING Yuelian , LIN Yanfei , CHEN Weiwen , HUANG Xinmin , HE Shenggen. Cloning and Bioinformatics Analysis of a Tonoplast Aquaporin Gene LlTIP2 in Lilium longiflorum[J]. Chinese Journal of Tropical Crops, 2011, 32(10): 1868-1872 |
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| Authors: | LI Hongmei DING Yuelian LIN Yanfei CHEN Weiwen HUANG Xinmin HE Shenggen |
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| Affiliation: | LI Hongmei,DING Yuelian,LIN Yanfei,CHEN Weiwen,HUANG Xinmin,HE Shenggen College of Life Sciences,Zhongkai University of Agriculture and Engineering,Guangzhou,Guangdong 510225,China |
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| Abstract: | Aquaporins,belong to major intrinsic proteins(MIPs)superfamily,are channel proteins of biological membranes including plasma membrane and tonoplast,which highly facilitate the transportation of water across these membranes.A tonoplast intrinsic proteins(TIPs)gene(LlTIP2,GenBank accession number: JN085950)was isolated from Lilium longiflorum leaves by RT-PCR and RACE.The full cDNA sequence of LlTIP2 was 986 bp,containing 208 bp 3'-UTR,34 bp 5'-UTR,and 744 bp open reading frame,which encoded 247 amino acids,p... |
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| Keywords: | Lilium longiflorum Aquaporins Tonoplast intrinsic proteins Gene cloning Sequence analysis |
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