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| 葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析 | |
| 作者单位： | ;1.江苏省连云港市农业科学院 |
| 摘 要： | 为了研究葡萄miR159基因家族在葡萄生长发育过程中发挥的作用,利用生物信息学工具和方法,对葡萄miR159家族成员进行了基因定位、前体序列二级结构预测、成熟序列保守性分析、靶基因及其功能预测以及系谱进化分析。结果显示:在葡萄miR159家族成员中vvi-miR159a和vvi-miR159b两个成员均分布在染色体15上,vvi-miR159c分布在染色体17上;葡萄miR159家族成员基本上符合进化规律;葡萄miR159家族成员的前体均可形成稳定的茎环结构,且其成熟序列都产生于其前体茎环结构的5'端臂上,其碱基序列保守性较高;葡萄miR159家族对应的靶基因主要有两个(GSVIVT01012447001与GSVIVT01037362001),经BLAST分析,主要为GAMYB转录因子家族。 |
| 关 键 词： | 葡萄 miR159 基因家族 分子进化 靶基因预测 |
Bioinformatics Analysis of miR159 Family and Prediction of Its Target Genes in Grape(Vitis vinifera) |
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| Keywords: | |