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杨梅S-SAP分子标记体系的建立及应用
作者单位:;1.宁波市农业科学研究院林业研究所
摘    要:基于杨梅全基因组Ty1-copia类型逆转座子LTR序列设计开发S-SAP引物组合,利用48份杨梅试材对其多态性指数进行评价,使用UPGMA(Unweighted Pair Group Method with Arithmatic Mean)法,构建了系统聚类树,并进行了二维和三维主坐标分析,进而探讨了杨梅种质资源遗传亲缘关系。成功开发了18个杨梅S-SAP引物组合,共扩增获得3739个条带,平均每个引物组合可扩增208个条带(100500 bp),每个引物组合扩增条带数量范围为98500 bp),每个引物组合扩增条带数量范围为98292,Shannon信息指数范围为0.2041292,Shannon信息指数范围为0.20410.4522。其中,引物组合JY20的多态性最高,可扩增出292个条带。基于18个S-SAP引物组合,使用UPGMA法构建所有试材的系统聚类树,结果共分为3个组及3个亚组。聚类分析与主坐标分析结果高度相似,具有相同地域来源的品种大部分被划分于同一个分组,使用聚类分析与主坐标分析所得结果基本一致,但是聚类结果与果实色泽没有明显的关联性,利用三维主坐标分析更能全面且真实地反映杨梅品种间的亲缘关系。

关 键 词:杨梅  S-SAP  分子标记  遗传多样性

Establishment and Application of S-SAP Molecular Marker System in Chinese Bayberry(Myrica rubra)
Abstract:
Keywords:
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