沙柳SpsNAC005基因克隆及生物信息学分析 |
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作者单位: | 内蒙古农业大学林学院,呼和浩特010019;鄂尔多斯市生态文化展览馆,鄂尔多斯017000 |
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基金项目: | 国家科技重大专项;国家自然科学基金;内蒙古自治区应用技术研究与开发项目 |
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摘 要: | 本研究以沙柳为材料,基于毛果杨、欧洲红皮柳的序列,采用同源克隆的方法获得沙柳SpsNAC005基因,利用生物信息学软件分析SpsNAC005基因序列、构建进化树、预测蛋白结构。结果显示,SpsNAC005基因的开放阅读框序列长度为927 bp,编码为308个氨基酸。生物信息学分析表明,SpsNAC005含有NAC基因家族的典型NAM结构域,具有A、B、C、D、E 5个保守亚结构域。SpsNAC005基因为亲水性蛋白,预测细胞定位在细胞核上,其可能作为转录激活因子在细胞核中行使功能。本研究为进一步探索NAC基因在沙柳抗逆胁迫调控中的机制研究提供了重要的科学依据。
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关 键 词: | 沙柳 NAC基因 生物信息学 |
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