| 洋草麦HdCAD基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 洋草麦HdCAD基因的克隆与生物信息学分析. 洋草麦HdCAD基因的克隆与生物信息学分析[J]. 畜牧与饲料科学, 2021, 42(3): 7-13. DOI: 10.12160/j.issn.1672-5190.2021.03.002 |
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| 作者姓名： | 洋草麦HdCAD基因的克隆与生物信息学分析 |
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| 作者单位： | 内蒙古自治区农牧业科学院,内蒙古 呼和浩特 010031 |
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| 基金项目： | 内蒙古自治区农牧业创新基金项目（2020CXJJM09）; 内蒙古自治区自然基金与内蒙古农牧业科学院青年联合基金项目[2016MS（LH）0305] |
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| 摘 要： | [目的]克隆洋草麦肉桂醇脱氢酶基因（HdCAD）,揭示HdCAD基因的序列特性,对HdCAD蛋白进行生物信息学分析。[方法]以洋草麦转录组数据中的HdCAD为参考序列,设计1对特异引物,利用RT-PCR技术克隆HdCAD基因;利用生物信息学软件对HdCAD基因序列进行分析,对HdCAD蛋白的理化性质、蛋白结构、亚细胞定位等进行预测和系统进化树分析。[结果]HdCAD基因编码区全长1 071 bp,共编码356个氨基酸。HdCAD蛋白含有17个磷酸化位点,不含有跨膜结构域和信号肽位点,预测定位在细胞质中;二级结构中,以无规卷曲元件占比最高;含有1个典型的CAD1结构域,属于MDR超家族。系统进化树分析结果显示,HdCAD蛋白与二粒小麦、节节麦、西藏裸大麦亲缘关系最近。[结论]该试验成功克隆HdCAD基因、预测了该基因编码蛋白的序列特征和功能,可以为今后研究洋草麦抗非生物胁迫功能提供参考。
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| 关 键 词： | 洋草麦 肉桂醇脱氢酶 基因克隆 生物信息学分析 |
| 收稿时间： | 2021-04-22 |
Cloning and Bioinformatic Analysis of HdCAD Gene in Hordeum distichon |
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| HAO Li-fen,FANG Yong-yu,SUN Lin,ZHAO Jun-li,SHI Zhi-dan,ZHAN He-nian,DING Hai-jun. Cloning and Bioinformatic Analysis of HdCAD Gene in Hordeum distichon[J]. Animal Husbandry and Feed Science, 2021, 42(3): 7-13. DOI: 10.12160/j.issn.1672-5190.2021.03.002 |
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| Authors: | HAO Li-fen FANG Yong-yu SUN Lin ZHAO Jun-li SHI Zhi-dan ZHAN He-nian DING Hai-jun |
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| Affiliation: | Inner Mongolia Academy of Agricultural and Animal Husbandry Sciences,Hohhot 010031,China |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Hordeum distichon cinnamyl alcohol dehydrogenase gene cloning bioinformatics analysis |
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