| 番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析 |
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| 引用本文： | 刘云飞,万红建,韦艳萍,李志邈,叶青静,王荣青,阮美颖,姚祝平,周国治,杨悦俭.番茄NBS-LRR抗病基因家族全基因组分析[J].核农学报,2014(5). |
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| 作者姓名： | 刘云飞 万红建 韦艳萍 李志邈 叶青静 王荣青 阮美颖 姚祝平 周国治 杨悦俭 |
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| 作者单位： | 南京农业大学园艺学院;浙江省农业科学院蔬菜研究所; |
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| 基金项目： | 国家“863”计划(2012AA100100);国家自然科学基金(31071800,31301774,31272156);浙江省自然科学基金(LQ12C15004);浙江省农业新品种选育重大科技专项(2012C12903);公益性行业(农业)科研专项经费(201003065);国家科技支撑计划(2012BAD02B02);国家大宗蔬菜产业技术体系(CARS-25-G-16);浙江省蔬菜产业创新团队(2009R50026) |
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| 摘 要： | NBS-LRR(nucleotide-binding site and leucine-rich-repeat)是植物中最大类抗病基因家族之一。番茄基因组测序完成为全基因组水平上分析NBS-LRR抗病基因家族提供了机遇。利用生物信息学方法对番茄NBS-LRR抗病基因家族成员数目进行鉴定,并对其染色体定位和系统发育关系进行了分析。随后,将番茄和马铃薯NBS-LRR抗病基因进行了比较基因组学分析。结果表明:番茄基因组共包括252个NBS-LRR抗病基因,分布于番茄12条染色体上;63.5%的基因成簇存在,大部分为串联重复;系统发育关系分析表明番茄CC-NBS-LRR(CNL)亚家族较其他亚家族扩展程度大;同线性分析发现番茄中共79个NBS-LRR抗病基因与马铃薯基因具有同源关系。结果将为番茄NBS-LRR抗病基因家族的深入研究提供依据,同时也为利用番茄NBS-LRR基因进行基因定位以及相关抗病基因克隆等奠定基础。
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| 关 键 词： | 番茄 NBS-LRR CNL TNL 抗病基因 |
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