花生茎全长cDNA文库的构建与分析 |
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引用本文: | 陈华,邓烨,张冲,蔡铁城,熊发前,唐荣华,周双彪,庄伟建.花生茎全长cDNA文库的构建与分析[J].核农学报,2014(10). |
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作者姓名: | 陈华 邓烨 张冲 蔡铁城 熊发前 唐荣华 周双彪 庄伟建 |
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作者单位: | 福建省作物分子与细胞生物学重点实验室;广西农业科学院经济作物研究所; |
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基金项目: | 科技部国际科技合作计划项目(2008DFA31450);国家“863”计划项目(2013AA102602-5);福建省科技厅高校产学合作科技重大项目(2011N51010064) |
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摘 要: | 为挖掘花生茎中重要的功能基因,了解花生茎生长发育的分子机理,以闽花6号为材料,利用SMART技术成功构建了花生茎不同生育时期混合的全长cDNA文库,并对文库的部分序列进行了测序及分析。结果表明,该文库原始库容为1.25×106cfu·mL-1,重组率达100%,插入片段大小为750~2 000 bp,平均插入片段大小为1 000bp,达到文库质量要求。随机挑选50个单克隆进行5'端测序,共获得50条有效序列。通过与NCBI非冗余蛋白质数据库进行比对和注释,获得已知功能基因或具推测功能的基因29个,未知功能基因9个,新基因12个,其中47个(94%)基因为花生未报道的基因。因此,该文库的构建为克隆和研究花生茎部重要表达基因,从分子水平上揭示花生茎的生长发育规律提供了基础。
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关 键 词: | 花生 SMART技术 全长cDNA文库 茎 |
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