| 铁皮石斛SEP3基因的生物信息学分析及敲除载体的构建 |
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| 引用本文： | 黄鑫,师凯辉,胡凇,田英男,冯垒,韩欣妤,孙博,王义琴,王冬梅,何玲,朱永平,和凤美.铁皮石斛SEP3基因的生物信息学分析及敲除载体的构建[J].安徽农业大学学报,2021,48(4):555-559. |
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| 作者姓名： | 黄鑫 师凯辉 胡凇 田英男 冯垒 韩欣妤 孙博 王义琴 王冬梅 何玲 朱永平 和凤美 |
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| 作者单位： | 云南农业大学园林园艺学院,昆明650201 |
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| 基金项目： | 国家自然科学基金项目(31760591)资助。 |
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| 摘 要： | SEP3(SEPALLATA3)基因是MADS-box家族中的一员,在花器官的形成和发育过程中具有重要作用.为了解SEP3基因在铁皮石斛(Dendrobium officinale)中的成花转变机理,从铁皮石斛转录组序列中获得一个SEP3基因序列,并命名为DoSEP3.预测其编码区长度为354 bp,预测编码117个氨基酸.DoSEP3蛋白相对分子质量13457.87 Da.其不稳定系数为60.53,亲水性的平均值为-0.121,是不稳定的亲水性蛋白,主要在内质网和细胞核中起作用.二级结构主要以α-螺旋为蛋白质最大量的结构元件,跨膜区分析推测DoSEP3蛋白质具有一个跨膜区.进一步的氨基酸比对显示,铁皮石斛DoSEP3蛋白与金钗石斛SEP3蛋白亲缘关系最近,可能具有类似的功能.基于生物信息学分析,利用CRISPR/cas9技术构建铁皮石斛基因敲除载体,并使用农杆菌介导法进行遗传转化,且已获得阳性原球茎,可为后续的SEP3基因表达研究奠定基础.
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| 关 键 词： | 铁皮石斛 SEP3基因 生物信息学分析 载体构建 |
| 收稿时间： | 2020/10/29 0:00:00 |
Bioinformatics analysis of SEP3 gene of Dendrobium officinalee and construction of knockout vector |
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| HUANG Xin,SHI Kaihui,HU Song,TIAN Yingnan,FENG Lei,HAN Xinyu,SUN Bo,WANG Yiqin,WANG Dongmei,HE Ling,ZHU Yongping,HE Fengmei.Bioinformatics analysis of SEP3 gene of Dendrobium officinalee and construction of knockout vector[J].Journal of Anhui Agricultural University,2021,48(4):555-559. |
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| Authors: | HUANG Xin SHI Kaihui HU Song TIAN Yingnan FENG Lei HAN Xinyu SUN Bo WANG Yiqin WANG Dongmei HE Ling ZHU Yongping HE Fengmei |
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| Institution: | College of Garden and Horticulture, Yunnan Agricultural University, Kunming 650201 |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Dendrobium officinale SEP3 bioinformatics analysis vector construction |
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