| 内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用 |
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| 引用本文： | 安光辉,严承欢,张维奕,彭丽莹,陈炯炯. 内含子序列在甘蓝MAGIC亲本间亲缘关系分析中的应用[J]. 华中农业大学学报, 2017, 36(1): 16-21 |
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| 作者姓名： | 安光辉 严承欢 张维奕 彭丽莹 陈炯炯 |
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| 作者单位： | 华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070,华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070,华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070,华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070,华中农业大学园艺林学学院/园艺植物生物学教育部重点实验室，武汉 430070 |
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| 基金项目： | 湖北省自然科学基金项目（2013CFB204） |
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| 摘 要： | 为探究甘蓝多亲本高级世代互交系(multiparent advanced generation inter-cross,MAGIC)亲本间的亲缘关系和遗传多样性,以便对MAGIC杂交亲本的选择提供依据,采用生物信息学的方法对单拷贝基因进行全基因组鉴定,并采用其内含子序列分析对7个甘蓝亚种共12个MAGIC亲本构建系统发育树。全基因组鉴定共获得7 930个单拷贝基因,每条染色体上随机挑选1条单拷贝基因,采用PCR方法进行内含子扩增并测序,最终获得3 427bp内含子长序列。运用邻接法构建系统发育树,可将甘蓝类蔬菜分为3大类型:花椰菜与西兰花类(CladeⅠ)、羽衣甘蓝类(CladeⅡ)以及结球甘蓝、抱子甘蓝、苤蓝与芥蓝类(CladeⅢ),表明内含子序列适于甘蓝亚种亲缘关系聚类;同时也表明,芥蓝属于甘蓝亚种,西兰花与花椰菜具有较近的亲缘关系;利用单拷贝基因内含子序列分析的方法可以较好地显示甘蓝MAGIC亲本间的亲缘关系,为MAGIC群体的构建提供参考。
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| 关 键 词： | 甘蓝； 单拷贝基因； 内含子； 系统进化树 |
| 收稿时间： | 2016-05-05 |
Application of intron sequence in phylogenetic relationship of MAGIC parents of Brassica oleracea |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | Brassica oleracea singlecopy genes intron phylogeny |
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