蛋鸡繁殖性能相关长链非编码RNA的筛选与鉴定 |
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作者单位: | 河北北方学院 实验动物中心,河北 张家口 075000;河北北方学院 教务处,河北 张家口 075000 |
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基金项目: | 河北省高等学校科学技术研究项目;河北省高等学校科学技术研究项目;张家口市科学技术研究与发展计划 |
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摘 要: | 该研究通过对比蛋鸡不同生长发育阶段卵巢组织,筛选鉴定与蛋鸡繁殖性能相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA, lncRNA)。通过提取20周龄(n=3)、30周龄(n=3)京红蛋鸡卵巢组织总RNA构建测序文库,利用RNA-seq技术及生物信息学分析方法鉴定差异表达lncRNA并进行qRT-PCR验证及功能富集分析。在不同周龄蛋鸡卵巢组织中共筛选鉴定到1 283个lncRNA表达,其中10个存在差异表达,qRT-PCR验证了测序结果。差异表达lncRNA显著富集到190条GO条目及5条KEGG通路中。研究结果表明lncRNA参与蛋鸡繁殖性能调控相关的生物学过程、细胞组分、分子功能以及多种信号通路。
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关 键 词: | 蛋鸡 繁殖性能 长链非编码RNA 卵巢 转录组测序 |
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