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苦楝SSR-PCR反应体系优化及引物筛选
引用本文:王芳,廖柏勇,李培,刘明骞,李俊成,吴琳瑛,林玮,陈晓阳.苦楝SSR-PCR反应体系优化及引物筛选[J].林业科学研究,2016,29(2):167-175.
作者姓名:王芳  廖柏勇  李培  刘明骞  李俊成  吴琳瑛  林玮  陈晓阳
作者单位:华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;北京林业大学生物科学与技术学院, 北京 100083;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642;华南农业大学林学与风景园林学院/广东省森林植物种质创新与利用重点实验室/亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室, 广东 广州 510642
基金项目:广东省林业科技创新项目(2011KJCX002)
摘    要:目的]借鉴以往楝属文献报道的SSR引物,筛选高度多态性、稳定性高、重复性好的苦楝SSR引物,为苦楝遗传图谱构建、QTL定位和分子标记辅助选择育种等研究领域应用奠定基础.方法]本研究采用单因素法和正交试验设计进行SSR-PCR反应体系优化,并利用该体系以8个不同种源的苦楝基因组DNA为模板,从135对候选SSR引物中进行引物筛选.结果]苦楝SSR-PCR最优反应体系为:1.0 μL 50 ng·μL-1模板DNA,1.2 μL 100 μmol·L-1引物,1.0 μL 10 mmol·L-1 dNTPs,0.8 μL 25 mmol·L-1 Mg2+,0.15 μL 5 U·μL-1 Taq酶,1.5 μL 10×Buffer,补ddH2O至15 μL;最终筛选出15对具有高度多态性、稳定性高、重复性好的SSR引物.结论]本研究成功优化了苦楝SSR-PCR反应体系,并成功筛选出15对适用于苦楝的SSR引物.

关 键 词:苦楝  SSR-PCR  体系优化  引物筛选
收稿时间:2015/3/20 0:00:00

Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening of Melia azedarach
WANG Fang,LIAO Bo-yong,LI Pei,LIU Ming-qian,LI Jun-cheng,WU Lin-ying,LIN Wei and CHEN Xiao-yang.Optimization of SSR-PCR Reaction System and Primer Screening of Melia azedarach[J].Forest Research,2016,29(2):167-175.
Authors:WANG Fang  LIAO Bo-yong  LI Pei  LIU Ming-qian  LI Jun-cheng  WU Lin-ying  LIN Wei and CHEN Xiao-yang
Institution:College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Biological Sciences and Technology, Beijing Forestry University, Beijing 100083, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China;College of Forestry and landscape Architecture, South China Agricultural University/Provincial Key Laboratory of Forest Plant Germplasm Innovation and Utilization/State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangzhou 510642, Guangdong, China
Abstract:
Keywords:Melia azedarach  SSR-PCR  system optimization  primer screening
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