草鱼褪黑激素受体Mtnr1基因克隆及组织表达分析 |
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作者姓名: | 胡伟 吴慧 袁汉文 郜卫华 陈敦学 郭利伟 许巧情 |
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作者单位: | 长江大学 湿地生态与农业利用教育部工程研究中心 湖北荆州 434023;湖南师范大学 省部共建淡水鱼类发育生物国家重点实验室 湖南 长沙410081,湖南师范大学 省部共建淡水鱼类发育生物国家重点实验室 湖南 长沙410081,长江大学 湿地生态与农业利用教育部工程研究中心 湖北荆州 434023,贵州大学动物科学学院 贵州 贵阳 550025 |
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基金项目: | 省部共建淡水鱼类发育生物国家重点实验室开放课题基金(2019KF010);湿地生态与农业利用教育部工程研究中心(KF201913);黔科合支撑([2019]2344)共同资助。 |
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摘 要: | 为了探究褪黑激素受体(melatonin receptor,Mtnr1)基因在草鱼(Ctenopharyngodon idella)中的表达模式和功能,采用RACE技术从草鱼组织中克隆获得Mtnr1基因的6个亚型(Mtnr1Aa、Mtnr1Ab、Mtnr1Alike、Mtnr1Ba、Mtnr1Bb和Mtnr1C)的cDNA序列,采用ProtParam、TMpred、NetPhos、NetNGlyc、Singal4.1及Phyre2等在线软件对Mtnr1基因的6种亚型进行生物信息学分析。同时,通过实时荧光定量PCR检测6种亚型在不同组织中的表达。结果显示,Mtnr1基因6个亚型cDNA全长分别为2045、2036、2031、2799、2535和2477 bp,分别编码350、351、344、356、347和361个氨基酸。6种亚型均由7个跨膜结构域、NRY结构域、CYICHS结构域和NAXXY结构域及G蛋白偶联受体结合位点组成,同时含有多个磷酸化位点和糖基化位点。Mtnr1基因6个亚型蛋白均由20种氨基酸组成,均属于稳定的亲水性蛋白。氨基酸序列比较分析发现,6种亚型与其他鱼对应的亚型同源性很高,分别为93.1%~99.4%、84.8%~95.2%、82.8%~96.8%、90.1%~97.5%、79.7%~98.3%和90.6%~95.6%。邻接法构建系统进化树显示,6种亚型均与鲤科(Cyprinidae)鱼类聚为一支,与鲤鱼(Cyprinus carpio)、鲫鱼(Carassius auratus)和斑马鱼(Danio rerio)亲缘关系最近。此外,6种亚型mRNA在草鱼肝脏、心脏、鳃、脑、肌肉、前肠、中肠、后肠和肾脏9个组织中均有表达,其中,Mtnr1Aa和Mtnr1Ba基因分别在脑和肾脏中表达量最高,表明Mtnr1Aa和Mtnr1Ba可能在草鱼的神经调节和免疫反应中发挥重要作用。
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关 键 词: | 褪黑激素受体 草鱼 分子克隆 组织表达 |
Molecular Cloning and Expression Analysis of the Melatonin Receptor Gene in Grass Carp(Ctenopharyngodon idella) |
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Authors: | HU Wei WU Hui YUAN Hanwen GAO Weihua CHEN Dunxue GUO Liwei XU Qiaoqing |
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Institution: | (Engineering Research Center of Ecology and Agricultural Use of Wetland,Ministry of Education,Yangtze University,Jingzhou,Hubei 434023,China;State Key Laboratory of Developmental Biology of Freshwater Fish,School of Life Sciences,Hunan Normal University,Changsha,Hu’nan 410081,China;School of Animal Science,Guizhou University,Guiyang,Guizhou 550025,China) |
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Abstract: | |
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Keywords: | Melatonin receptor Ctenopharyngodon idella Gene cloning Tissue expression |
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