小桐子miR394家族鉴定及其靶基因的低温表达特性 |
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作者单位: | 曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,曲靖,655011;曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,曲靖,655011;曲靖师范学院,云南高原生物资源保护与利用研究中心,曲靖,655011 |
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基金项目: | 国家级大学生创新创业训练计划项目;国家自然科学基金 |
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摘 要: | MicroRNA (miRNA)是植物基因转录与翻译的重要调控因子,miR394参与植物多种抗逆性的调节过程。为深入研究miR394在小桐子抗冷性中的调控机制,利用生物信息学方法对小桐子miR394进行鉴定及靶基因预测,并通过实时荧光定量PCR分析了jcu-miR394及其预测靶基因在低温胁迫下的差异表达特性。结果表明,小桐子中共鉴定到两个miR394基因(jcu-MIR394a, jcu-MIR394b),都可形成稳定的茎环结构,成熟体序列都位于茎环结构的5′端,且都为20 nt (5′-UUGGCAUUCUGUCCACCUCC-3′)。靶基因预测与RT-qPCR表达分析显示,小桐子FBXO6是miR394的潜在靶基因,并可能通过miR394b-FBXO6靶向互作参与小桐子抗冷性过程。本研究结果为开展小桐子miR394参与抗冷性机制研究奠定了基础。
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关 键 词: | 小桐子 miR394 F-box only protein 6 靶基因 抗冷性 |
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