巴西橡胶树RALF基因家族的鉴定及其表达分析 |
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作者单位: | 中国热带农业科学院橡胶研究所,农业农村部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,农业农村部儋州热带作物科学观测实验站,省部共建国家重点实验室培育基地-海南省热带作物栽培生理学重点实验室,海口,571101 |
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基金项目: | 国家自然科学基金;海南省自然科学基金;中国热带农科院基本科研业务费专项 |
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摘 要: | 快速碱化因子(rapid alkalinization factors, RALFs)是一种植物多肽类激素,参与胞内MAPK信号传递、细胞伸长调控、花器官发育及免疫应答等植物重要生理过程。本研究利用生物信息学方法对橡胶树RALF基因家族进行全基因组鉴定,对其序列特性、基因结构、保守基序、系统进化及表达特性进行系统研究。通过同源比对在橡胶树基因组中共鉴定到16个RALF基因,分别命名为HbRALF1~HbRALF16。序列分析结果表明,这些基因编码氨基酸数目介于108~149 aa之间,分子量和等电点分别介于11.92~16.88 kD和5.41~9.33。多序列比对结果表明,HbRALFs含有S1P蛋白酶识别位点、受体蛋白识别位点YISY保守序列和四个保守半胱氨酸。基于转录组数据的组织和乙烯刺激表达特性分析显示,16个橡胶树RALF基因至少在一个组织中表达,8个胶乳中高表达的RALF还参与乙烯刺激响应。本研究为进一步研究RALF基因家族在橡胶树关键农艺性状调控中的作用提供参考依据。
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关 键 词: | 巴西橡胶树 RALF 快速碱化因子 基因家族 生物信息学 |
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