| 沈阳地区1株猪流行性腹泻病毒S1基因序列测定与分析 |
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| 引用本文： | 王宏燕. 沈阳地区1株猪流行性腹泻病毒S1基因序列测定与分析[J]. 现代畜牧兽医, 2019, 0(4): 6-11 |
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| 作者姓名： | 王宏燕 |
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| 作者单位： | 辽宁省农业发展服务中心,辽宁 沈阳,110032 |
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| 摘 要： | 利用PEDV的S1基因的特异性引物,克隆了沈阳地区1株PEDV流行毒株(LNSY-2017)的S1基因,并通过S1基因序列比对,分析了此病毒株与其他相关毒株的亲缘关系。结果显示:LNSY-2017株S1基因(2 372 bp)与我国疫苗株CV777(2 364 bp)相比,存在16个核苷酸的插入和8个核苷酸的缺失,导致推导的氨基酸序列存在6个氨基酸的插入(56G、59QGVN62和69G)和6个氨基酸的缺失(73N、157FA158、380YL381和521G),且在2个主要中和抗体表位(aa499～637和aa763～770)有11处氨基酸的突变。遗传进化分析结果显示,LNSY-2017与主要的疫苗株同源性较低(91.4%～92.5%),而与2012年韩国毒株、美国2013年毒株以及中国近年来流行毒株同源性最高(97.0%～98.7%),属于基因G2b型。结果表明,沈阳地区的PEDV流行株已经发生很大变异,因此很有必要加强对PEDV变异的监测。
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| 关 键 词： | 猪流行性腹泻病毒 S1基因 序列分析 遗传进化分析 |
Sequencing and analysis of S1 gene of porcine epidemic diarrhea virus in Shenyang area |
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| Wang Hongyan. Sequencing and analysis of S1 gene of porcine epidemic diarrhea virus in Shenyang area[J]. Modern JOurnal of Animal Husbandry and Veterinary Medicine, 2019, 0(4): 6-11 |
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| Authors: | Wang Hongyan |
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| Affiliation: | (Liaoning Center for Agricultural Development Service, Liaoning Shenyang 110032) |
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| Abstract: | Wang Hongyan(Liaoning Center for Agricultural Development Service, Liaoning Shenyang 110032) |
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| Keywords: | PEDV S1 Sequence analysis Phylogenetic analysis |
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