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高羊茅SBP117基因生物信息学分析
引用本文:罗龙龙,顾亚荣,任卫合,李凤迪,王明明.高羊茅SBP117基因生物信息学分析[J].现代畜牧兽医,2019(1):23-26.
作者姓名:罗龙龙  顾亚荣  任卫合  李凤迪  王明明
作者单位:西北民族大学生命科学与工程学院
基金项目:西北民族大学中央高校基本科研业务费资金资助项目(Y18101)
摘    要:为探讨硅结合蛋白(silica-binding protein 117,SBP117)基因的生物学功能,采用生物信息学方法从分子水平对其编码产物进行预测和分析。结果表明,SBP117基因CDS区共编码416个氨基酸残基,富含脯氨酸、甘氨酸、赖氨酸,且脯氨酸含量占总氨基酸总数的43.3%;其编码蛋白是一种不稳定类蛋白质,蛋白质分子质量为46 539.07,理论等电点为9.06;氨基酸亲水性/疏水性预测发现,SBP117基因编码氨基酸从40位之后均为亲水性氨基酸,为亲水性蛋白;二级结构中以无规则卷曲为主,且其比例高达占90.87%,三级结构预测发现主要由螺旋构成。本研究结果为硅结合蛋白在分子领域的进一步研究奠定了理论基础。

关 键 词:  硅结合蛋白  生物信息学分析

Bioinformatics analysis of SBP117 gene in Festuca arundinacea
Luo longlong,Gu Yarong,Ren Weihe,Li Fengdi,Wang Mingming.Bioinformatics analysis of SBP117 gene in Festuca arundinacea[J].Modern JOurnal of Animal Husbandry and Veterinary Medicine,2019(1):23-26.
Authors:Luo longlong  Gu Yarong  Ren Weihe  Li Fengdi  Wang Mingming
Institution:(School of life sciences and engineering,northwestern university of nationalities,Gansu LanZhou 730100)
Abstract:Luo longlong;Gu Yarong;Ren Weihe;Li Fengdi;Wang Mingming(School of life sciences and engineering,northwestern university of nationalities,Gansu LanZhou 730100)
Keywords:Silicon  Silicon binding protein  Bioinformatics analysis
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