2个地理种群大银鱼COⅠ基因序列变异与遗传分化 |
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引用本文: | 赵琳,张敏莹,徐东坡,周彦锋,方弟安,段金荣,刘凯.2个地理种群大银鱼COⅠ基因序列变异与遗传分化[J].大连海洋大学学报,2016(3):285-289. |
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作者姓名: | 赵琳 张敏莹 徐东坡 周彦锋 方弟安 段金荣 刘凯 |
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作者单位: | 1. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站,江苏无锡214081;南京农业大学渔业学院,江苏无锡214081;2. 中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部长江下游渔业资源环境科学观测实验站,江苏无锡,214081 |
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基金项目: | 国家科技基础条件平台建设运行项目(2015DKA30470-003),中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(2013JBFM07) |
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摘 要: | 为探究大银鱼Protosalanx hyalocranius不同地理种群的遗传变异情况,采用PCR产物纯化测序方法,测定了太湖、洪泽湖两个种群共96尾大银鱼线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因的部分序列。结果表明:在638 bp序列中共检测到6个变异位点,占核苷酸总数的0.94%;A、G、T、C平均含量依次为26.2%、34.0%、21.3%和18.5%,A+T含量(47.5%)低于G+C含量(52.5%);共发现7种单倍型,其中hap1、hap5和hap7为共享单倍型,hap6为洪泽湖种群特有,hap2、hap3和hap4为太湖种群特有,在7种单倍型中,hap1为明显的优势单倍体型,共54个个体(占总个体数的56.25%);平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.642和0.001 48,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,种群内遗传变异为79.82%,种群间变异为20.18%,两种群间遗传分化系数(Fst)为0.201 79,表明两种群间遗传分化程度较高。本研究结果可为合理开发和利用大银鱼野生资源提供参考。
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关 键 词: | 大银鱼 地理种群 线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(COⅠ) 遗传分化 |
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