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海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析
引用本文:常凯军,谭德冠,李定琴,孙雪飘,张家明. 海南橡胶藻18S rDNA与16S rDNA二级结构构建及分析[J]. 安徽农业科学, 2009, 37(27): 12965-12967
作者姓名:常凯军  谭德冠  李定琴  孙雪飘  张家明
作者单位:中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101;中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海南海口,571101
摘    要:[目的]对海南橡胶藻的新属、新种地位进行确认。[方法]对海南橡胶藻这一重要生物资源的18S核编码核糖体RNA序列和16S叶绿体编码核糖体RNA序列进行分析,对18S核编码核糖体RNA进行近缘物种间的序列比对及2个I类内含子二级结构模型的构建。[结果]橡胶藻16SrRNA在639位点(Ecoli序列编号)有一个46bp的插入片段,该片段能形成一个完美的双发夹结构。对16SrRNA的正常折叠不会产生影响。[结论]这一双发夹结构在其他物种的叶绿体rDNA中还未见报道过。

关 键 词:18S核编码核糖体RNA  16S叶绿体编码核糖体RNA  I类内舍子  双发夹结构

The Secondary Structure Model Building and Analysing of Heveochlorella hainangensis sp. nov.
CHANG Kai-jun et al. The Secondary Structure Model Building and Analysing of Heveochlorella hainangensis sp. nov.[J]. Journal of Anhui Agricultural Sciences, 2009, 37(27): 12965-12967
Authors:CHANG Kai-jun et al
Affiliation:CHANG Kai-jun et al (Institute of Tropical Bioscience , Biotechnology,Chinese Academy of Tropical Agricultural Sciences,Key labo-ratory of Tropical Crop Biotechnology,Ministry of Agriculture,Haikou,Hainan 571101)
Abstract:[Objective]The research aimed to affirm the new category and new species status of Heveochlorella hainangensis sp.nov..[Method]The huclear encoded 18S rDNA and the nuclear encoded 16S rDNA were analyzed.The nuclear sequence between H.Hainangensis and thenearly relationship varieties were contrasted.And the secondary structure model of two group I intron was built.[Result]Alignment analysis reyealed a uunique feature of 16S rDNA with an insertion of46 bp atposition 639(E.coli nnumbering) in helix P21-1.This ...
Keywords:18S rDNA  16S rDNA  Group I intron  Double hairpin structure  
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