DNA去甲基化酶对拟南芥Laccase家族基因甲基化及转录模式的影响 |
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引用本文: | 孔维文,王彬,陈伟,丁立,贾祥子,郑晓慧,花文涓,徐小勇.DNA去甲基化酶对拟南芥Laccase家族基因甲基化及转录模式的影响[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2019(3):27-33. |
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作者姓名: | 孔维文 王彬 陈伟 丁立 贾祥子 郑晓慧 花文涓 徐小勇 |
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作者单位: | 扬州大学园艺与植物保护学院,江苏扬州,225009;临沂出入境检验检疫局综合技术服务中心,山东临沂,276034 |
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基金项目: | 国家重点实验室开放基金 |
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摘 要: | 植物Laccase家族蛋白,是铜蓝氧化酶超家族的重要成员,具有包括抗病性在内的多种生物学功能。利用拟南芥野生型及ros1、rdd和dme突变体的全基因组甲基化测序(BS-SEQ)数据,分析了拟南芥Laccase蛋白家族基因(AtLACs)的DNA甲基化模式。结果表明:在野生型和不同DNA去甲基化酶突变体中,该家族少数成员在基因上游区和转录区存在较高水平的甲基化修饰现象。转录组测序(RNA-SEQ)数据分析结果显示,在野生型和不同突变体中,AtLAC家族基因的转录水平普遍较低。而AT5G48100基因在拟南芥胚乳细胞中剧烈表达,DME突变后,其表达水平进一步剧烈增强。综合而言,在野生型和不同DNA去甲基化酶突变体中,AtLAC基因家族大部分成员的DNA甲基化修饰与转录调控关联不强,但有些基因的DNA甲基化程度与转录水平之间有密切联系。
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关 键 词: | 拟南芥 Laccase DNA去甲基化酶 转录调控 |
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